RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 ATP7BP35670 1465 aa21.83■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.83■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CNGA3-205ENST00000436404 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.82■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.82■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.82■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.81■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.81■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.8■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.79■■□□□ 1.08
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CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.78■■□□□ 1.08
CNGA3-205ENST00000436404 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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CNGA3-205ENST00000436404 CABP1Q9NZU7 370 aa21.76■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PP64 1363 aa21.76■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.76■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 ITSN1Q15811 1721 aa21.75■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 AKAP12Q02952 1782 aa21.75■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.74■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.73■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 NUTM2FA1L443 756 aa21.73■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 FAM161AQ3B820 660 aa21.73■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 RALBP1Q15311 655 aa21.72■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 CRBNQ96SW2 442 aa21.72■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.72■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.72■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM94Q12767 1356 aa21.72■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.71■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.71■■□□□ 1.07
CNGA3-205ENST00000436404 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.7■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.7■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.7■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 PLIN1O60240 522 aa21.69■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
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CNGA3-205ENST00000436404 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.69■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 C8orf34Q49A92 452 aa21.69■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 ZMYND15Q9H091 742 aa21.68■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.68■■□□□ 1.06
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CNGA3-205ENST00000436404 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.66■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.66■■□□□ 1.06
CNGA3-205ENST00000436404 C14orf37Q86TY3 774 aa21.65■■□□□ 1.06
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CNGA3-205ENST00000436404 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.64■■□□□ 1.06
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CNGA3-205ENST00000436404 DCCP43146 1447 aa21.63■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 ACEP12821 1306 aa21.63■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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CNGA3-205ENST00000436404 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.61■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 NLRP13Q86W25 1043 aa21.6■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 MST1RQ04912 1400 aa21.59■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.59■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 USP6P35125 1406 aa21.59■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 SSH2Q76I76 1423 aa21.59■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.58■■□□□ 1.05
CNGA3-205ENST00000436404 FYB1O15117 783 aa21.58■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 NSD2O96028 1365 aa21.58■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 MSH6P52701 1360 aa21.56■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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CNGA3-205ENST00000436404 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.55■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
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CNGA3-205ENST00000436404 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.55■■□□□ 1.04
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CNGA3-205ENST00000436404 KIF1AQ12756 1690 aa21.53■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 ATF3P18847 181 aa21.53■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.53■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.52■■□□□ 1.04
CNGA3-205ENST00000436404 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.52■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 NME9Q86XW9 330 aa21.52■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 PIK3C2AO00443 1686 aa21.51■■□□□ 1.03
CNGA3-205ENST00000436404 MORC1Q86VD1 984 aa21.51■■□□□ 1.03
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