RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.67■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 IL16Q14005 1332 aa29.67■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.66■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 USP35Q9P2H5 1018 aa29.65■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.65■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP7BP35670 1465 aa29.64■■■□□ 2.34
RABGGTA-202ENST00000399409 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 CABP1Q9NZU7 370 aa29.62■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 TSPOAP1O95153 1857 aa29.62■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 ZMYM3Q14202 1370 aa29.61■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 RLBP1P12271 317 aa29.61■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.6■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.6■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.6■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.58■■■□□ 2.33
RABGGTA-202ENST00000399409 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.55■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 FCHSD2O94868 740 aa29.55■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 TNNQ9UQP3 1299 aa29.55■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 RIPK4P57078 832 aa29.53■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 NEFMP07197 916 aa29.52■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.52■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 BCL11AQ9H165 835 aa29.51■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.51■■■□□ 2.32
RABGGTA-202ENST00000399409 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.48■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 SIRT1Q96EB6 747 aa29.48■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 POLKQ9UBT6 870 aa29.47■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.47■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.46■■■□□ 2.31
RABGGTA-202ENST00000399409 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.45■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.45■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.45■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 MLECQ14165 292 aa29.44■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.44■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.43■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 KIF16BQ96L93 1317 aa29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM27P14373 513 aa29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 TECPR2O15040 1411 aa29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 USP19O94966 1318 aa29.41■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF428Q96B54 188 aa29.41■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 METP08581 1390 aa29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 PRKAR2BP31323 418 aa29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC4A3P48751 1232 aa29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
RABGGTA-202ENST00000399409 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 NFE2L2Q16236 605 aa29.37■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 CPS1P31327 1500 aa29.37■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.35■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.35■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.34■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 IL13P35225 146 aa29.33■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.33■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 TNRQ92752 1358 aa29.33■■■□□ 2.29
RABGGTA-202ENST00000399409 SEC24BO95487 1268 aa29.32■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 NME9Q86XW9 330 aa29.32■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 BECN1Q14457 450 aa29.31■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 NFKBIBQ15653 356 aa29.31■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 COG3Q96JB2 828 aa29.31■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.3■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 AKAP12Q02952 1782 aa29.3■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.29■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.29■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 FBLN1P23142 703 aa29.29■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa29.29■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 GNAI1P63096 354 aa29.28■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 ITSN1Q15811 1721 aa29.28■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.28■■■□□ 2.28
RABGGTA-202ENST00000399409 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms