RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
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HOXD13-201ENST00000392539 NME9Q86XW9 330 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXD13-201ENST00000392539 IFT57Q9NWB7 429 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXD13-201ENST00000392539 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
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HOXD13-201ENST00000392539 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
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HOXD13-201ENST00000392539 TBC1D2Q9BYX2 928 aa33.32■■■□□ 2.92
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