RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 RIPK4P57078 832 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC13-202ENST00000366662 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.05■■□□□ 1.12
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TTC13-202ENST00000366662 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC13-202ENST00000366662 SOX12O15370 315 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC13-202ENST00000366662 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TTC13-202ENST00000366662 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TTC13-202ENST00000366662 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC13-202ENST00000366662 ZMYM3Q14202 1370 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC13-202ENST00000366662 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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TTC13-202ENST00000366662 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.02■■□□□ 1.12
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TTC13-202ENST00000366662 IL27Q8NEV9 243 aa22.01■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 POLKQ9UBT6 870 aa22.01■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 PRKAR2BP31323 418 aa22■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 SLC26A8Q96RN1 970 aa22■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 PHACTR3Q96KR7 559 aa22■■□□□ 1.11
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TTC13-202ENST00000366662 PDE3AQ14432 1141 aa21.99■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 C8orf34Q49A92 452 aa21.99■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 NGEFQ8N5V2 710 aa21.99■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.99■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.98■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.98■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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TTC13-202ENST00000366662 NLRP1Q9C000 1473 aa21.95■■□□□ 1.11
TTC13-202ENST00000366662 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 CCDC27Q2M243 656 aa21.94■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 FAM161AQ3B820 660 aa21.94■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 USP32Q8NFA0 1604 aa21.93■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 LTKP29376 864 aa21.93■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 SEC24BO95487 1268 aa21.93■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.92■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.91■■□□□ 1.1
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TTC13-202ENST00000366662 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.9■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.9■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 FAM83GA6ND36 823 aa21.9■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 TRIM27P14373 513 aa21.9■■□□□ 1.1
TTC13-202ENST00000366662 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.89■■□□□ 1.09
TTC13-202ENST00000366662 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.89■■□□□ 1.09
TTC13-202ENST00000366662 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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TTC13-202ENST00000366662 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.87■■□□□ 1.09
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TTC13-202ENST00000366662 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.86■■□□□ 1.09
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TTC13-202ENST00000366662 TNRQ92752 1358 aa21.86■■□□□ 1.09
TTC13-202ENST00000366662 TSPYL6Q8N831 410 aa21.86■■□□□ 1.09
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TTC13-202ENST00000366662 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
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TTC13-202ENST00000366662 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.84■■□□□ 1.09
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TTC13-202ENST00000366662 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.83■■□□□ 1.08
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TTC13-202ENST00000366662 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.82■■□□□ 1.08
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TTC13-202ENST00000366662 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.8■■□□□ 1.08
TTC13-202ENST00000366662 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.8■■□□□ 1.08
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TTC13-202ENST00000366662 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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TTC13-202ENST00000366662 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.76■■□□□ 1.07
TTC13-202ENST00000366662 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TTC13-202ENST00000366662 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TTC13-202ENST00000366662 MBIPQ9NS73 344 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC13-202ENST00000366662 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC13-202ENST00000366662 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC13-202ENST00000366662 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TTC13-202ENST00000366662 REREQ9P2R6 1566 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC13-202ENST00000366662 MED14O60244 1454 aa21.74■■□□□ 1.07
TTC13-202ENST00000366662 ATP7BP35670 1465 aa21.74■■□□□ 1.07
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