RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 TRDNQ13061 729 aa19.08■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 LRRCC1Q9C099 1032 aa19.08■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 GGT6Q6P531 493 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 CNTROBQ8N137 903 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.07■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 TNNT1P13805 278 aa19.06■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 GBP3Q9H0R5 595 aa19.06■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 CBFA2T2O43439 604 aa19.06■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 FAM107BQ9H098 131 aa19.06■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.05■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 SHTN1A0MZ66 631 aa19.05■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 FAM193AP78312 1265 aa19.05■□□□□ 0.64
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CTIF-201ENST00000256413 SKAP1Q86WV1 359 aa19.05■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.04■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 19.3
CTIF-201ENST00000256413 CEP57L1Q8IYX8 460 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 G3V3G9 751 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 AMPHP49418 695 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 DCAF8Q5TAQ9 597 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 PPP2R1AP30153 589 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 PPFIBP1Q86W92 1011 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 CHD1LQ86WJ1 897 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 MAP3K11Q16584 847 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 NFXL1Q6ZNB6 911 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 INCENPQ9NQS7 918 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.04■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 MVPQ14764 893 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 STK38Q15208 465 aa19.03■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.03■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 EVC2Q86UK5 1308 aa19.03■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 CCDC183Q5T5S1 534 aa19.02■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 KRT222Q8N1A0 295 aa19.02■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 USP25Q9UHP3 1055 aa19.02■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 DYDC1Q8WWB3 177 aa19.02■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 SSFA2P28290 1259 aa19.02■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 PANK2Q9BZ23 570 aa19.02■□□□□ 0.64
CTIF-201ENST00000256413 OFD1O75665 1012 aa19.01■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.01■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 DDX11Q96FC9 970 aa19.01■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 VPS53Q5VIR6 699 aa19■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 SPATA32Q96LK8 384 aa19■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 PRM3Q9NNZ6 103 aa19■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 CRACR2AQ9BSW2 395 aa19■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.99■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 CCDC181Q5TID7 509 aa18.99■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 IQCEQ6IPM2 695 aa18.99■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.98■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 ERLIN2O94905 339 aa18.98■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 ME1P48163 572 aa18.98■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 TXLNBQ8N3L3 684 aa18.98■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.98■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 COG3Q96JB2 828 aa18.98■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.638e-9■■■■□ 21.2
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CTIF-201ENST00000256413 SMARCA2P51531 1590 aa18.97■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 NECTIN2Q92692 538 aa18.97■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 DACH1Q9UI36 760 aa18.97■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 KIF3BO15066 747 aa18.96■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 ODF2Q5BJF6 829 aa18.96■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.96■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 ADCY5O95622 1261 aa18.96■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 JMYQ8N9B5 988 aa18.96■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN12O43309 604 aa18.96■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD1Q15327 319 aa18.96■□□□□ 0.63
CTIF-201ENST00000256413 WDR97A6NE52 1622 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 SMTNL1A8MU46 457 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 NEMFO60524 1076 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 LMAN1P49257 510 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.95■□□□□ 0.62
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