RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254190.3

CHSY1-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY1, Length 4,550 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1-201ENST00000254190 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 IFT140Q96RY7 1462 aa29■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.99■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 CNTROBQ8N137 903 aa28.99■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.99■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 RAPGEF3O95398 923 aa28.98■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 IFT57Q9NWB7 429 aa28.98■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 TPM3P06753 285 aa28.98■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.98■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.98■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.98■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 MCM2P49736 904 aa28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF428Q96B54 188 aa28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 FSD1Q9BTV5 496 aa28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC39Q9UFE4 941 aa28.96■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 FCHSD2O94868 740 aa28.95■■■□□ 2.23
CHSY1-201ENST00000254190 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.95■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 ABTB2Q8N961 1025 aa28.94■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.94■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 HOMER1Q86YM7 354 aa28.94■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.94■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 TRDNQ13061 729 aa28.93■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC173Q0VFZ6 552 aa28.92■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 TRIM29Q14134 588 aa28.92■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.92■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 IQGAP2Q13576 1575 aa28.91■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.91■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.91■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa28.9■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 ESPNB1AK53 854 aa28.9■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 IGHDP01880 384 aa28.9■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 TSPY26PQ9H489 355 aa28.9■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 SDF4Q9BRK5 362 aa28.89■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.89■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.89■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 NFE2L2Q16236 605 aa28.89■■■□□ 2.22
CHSY1-201ENST00000254190 EVA1CP58658 441 aa28.89■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 DCTN1Q14203 1278 aa28.88■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.88■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.88■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
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CHSY1-201ENST00000254190 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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CHSY1-201ENST00000254190 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.85■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.85■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 TRIM27P14373 513 aa28.84■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.83■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.83■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.83■■■□□ 2.21
CHSY1-201ENST00000254190 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.82■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 MARCH6O60337 910 aa28.82■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 PDCP20941 246 aa28.82■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 TPM1P09493 284 aa28.81■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 SPC24Q8NBT2 197 aa28.81■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.81■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.8■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.8■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 SRGAP3O43295 1099 aa28.79■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 KDM4AO75164 1064 aa28.79■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 MCM10Q7L590 875 aa28.79■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 SIL1Q9H173 461 aa28.79■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.77■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 STK3Q13188 491 aa28.77■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa28.77■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.77■■■□□ 2.2
CHSY1-201ENST00000254190 TPM2P07951 284 aa28.76■■■□□ 2.19
CHSY1-201ENST00000254190 PDE4CQ08493 712 aa28.76■■■□□ 2.19
CHSY1-201ENST00000254190 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CHSY1-201ENST00000254190 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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