RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000056233.3

NFE2L3-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L3, Length 3,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3-201ENST00000056233 TPM2P07951 284 aa20.73■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 ADGRL2O95490 1459 aa20.72■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 NUCB2P80303 420 aa20.72■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 C14orf37Q86TY3 774 aa20.72■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 FSD2A1L4K1 749 aa20.71■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM177BA6PVY3 158 aa20.71■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 PKP1Q13835 747 aa20.71■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 TSPYL6Q8N831 410 aa20.71■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC27Q2M243 656 aa20.71■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 PIK3C2GO75747 1445 aa20.7■□□□□ 0.91
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM83GA6ND36 823 aa20.7■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 DRC7Q8IY82 874 aa20.7■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.7■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 CABP1Q9NZU7 370 aa20.69■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 ADAMTS12P58397 1594 aa20.69■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 PLA2R1Q13018 1463 aa20.69■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 NUCB1Q02818 461 aa20.69■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.68■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 PRAM1Q96QH2 718 aa20.68■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 IFT140Q96RY7 1462 aa20.68■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.68■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 MCCP23508 829 aa20.67■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.67■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 KCNJ4P48050 445 aa20.67■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.66■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.66■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 SMC5Q8IY18 1101 aa20.66■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 GCC1Q96CN9 775 aa20.66■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 RABEP1Q15276 862 aa20.65■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 KRT24Q2M2I5 525 aa20.65■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 TSC1Q92574 1164 aa20.65■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.64■□□□□ 0.9
NFE2L3-201ENST00000056233 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.64■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.64■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 INSRP06213 1382 aa20.64■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 SPC24Q8NBT2 197 aa20.64■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 RBSNQ9H1K0 784 aa20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 REC8O95072 547 aa20.63■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 NOS1P29475 1434 aa20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 GNAI1P63096 354 aa20.62■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 FIBPO43427 364 aa20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 F6X3S4 739 aa20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3-201ENST00000056233 HMMRO75330 724 aa20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 CBX1P83916 185 aa20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 USP25Q9UHP3 1055 aa20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 MCM10Q7L590 875 aa20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 STAC3Q96MF2 364 aa20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 IGSF3O75054 1194 aa20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF592Q92610 1267 aa20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 SNX21Q969T3 373 aa20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 SLC4A2P04920 1241 aa20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 PBRM1Q86U86 1689 aa20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 TSPY26PQ9H489 355 aa20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 CEP170Q5SW79 1584 aa20.55■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.55■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 SDSP20132 328 aa20.55■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NFE2L3-201ENST00000056233 CDK19Q9BWU1 502 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms