RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421750.1

TRAPPC2P4-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC2P4, Length 331 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AMNQ9BXJ7 453 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FETUBQ9UGM5 382 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SARDHQ9UL12 918 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 A0A1W2PR48 441 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BTBD18B2RXH4 712 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 H0YC42 278 aa3.63□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PSMD14O00487 310 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SYN3O14994 580 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MCF2LO15068 1137 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SEPT4O43236 478 aa3.63□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CUTAO60888 179 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GPR32O75388 356 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TAF5LO75529 589 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RPP40O75818 363 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DNAJB5O75953 348 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MPIG6BO95866 241 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 IFNB1P01574 187 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GNAI2P04899 355 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GRPP07492 148 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GJB1P08034 283 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SBK3P0C264 359 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PDHBP11177 359 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PTGS1P23219 599 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMOD1P28289 359 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PCSK1P29120 753 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PBX3P40426 434 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NRIP1P48552 1158 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TRPC1P48995 793 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SULT1E1P49888 294 aa3.63□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 STARD6P59095 220 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CTXN1P60606 82 aa3.63□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NPY5RQ15761 445 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MST1LQ2TV78 715 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GLRA4Q5JXX5 417 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 WDR93Q6P2C0 686 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MED25Q71SY5 747 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MFSD4AQ8N468 514 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FSIP1Q8NA03 581 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CEP76Q8TAP6 659 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SNX33Q8WV41 574 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ELP4Q96EB1 424 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SAAL1Q96ER3 474 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CRACR2AQ9BSW2 395 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SOX7Q9BT81 388 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TCHPQ9BT92 498 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TTPALQ9BTX7 342 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TASP1Q9H6P5 420 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RXFP1Q9HBX9 757 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ANO10Q9NW15 660 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KCND2Q9NZV8 630 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KCMF1Q9P0J7 381 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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