Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTXN1P60606 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTXN1P60606 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CTXN1P60606 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTXN1P60606 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTXN1P60606 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTXN1P60606 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTXN1P60606 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTXN1P60606 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTXN1P60606 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CTXN1P60606 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTXN1P60606 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTXN1P60606 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTXN1P60606 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTXN1P60606 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTXN1P60606 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTXN1P60606 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTXN1P60606 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTXN1P60606 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTXN1P60606 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTXN1P60606 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTXN1P60606 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTXN1P60606 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTXN1P60606 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTXN1P60606 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTXN1P60606 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTXN1P60606 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTXN1P60606 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTXN1P60606 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTXN1P60606 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTXN1P60606 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTXN1P60606 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTXN1P60606 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTXN1P60606 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CTXN1P60606 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTXN1P60606 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTXN1P60606 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTXN1P60606 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTXN1P60606 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTXN1P60606 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTXN1P60606 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTXN1P60606 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTXN1P60606 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTXN1P60606 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTXN1P60606 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTXN1P60606 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTXN1P60606 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTXN1P60606 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTXN1P60606 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTXN1P60606 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTXN1P60606 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTXN1P60606 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTXN1P60606 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTXN1P60606 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTXN1P60606 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTXN1P60606 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTXN1P60606 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTXN1P60606 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTXN1P60606 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTXN1P60606 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTXN1P60606 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTXN1P60606 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTXN1P60606 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTXN1P60606 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTXN1P60606 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTXN1P60606 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTXN1P60606 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTXN1P60606 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTXN1P60606 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTXN1P60606 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTXN1P60606 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTXN1P60606 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTXN1P60606 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTXN1P60606 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTXN1P60606 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTXN1P60606 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTXN1P60606 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTXN1P60606 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTXN1P60606 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CTXN1P60606 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTXN1P60606 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTXN1P60606 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTXN1P60606 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTXN1P60606 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CTXN1P60606 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTXN1P60606 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTXN1P60606 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTXN1P60606 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTXN1P60606 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTXN1P60606 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTXN1P60606 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTXN1P60606 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTXN1P60606 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTXN1P60606 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTXN1P60606 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTXN1P60606 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTXN1P60606 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTXN1P60606 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTXN1P60606 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTXN1P60606 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms