RNA–Protein interactions for RNA: tR(UCU)Q1

tR(UCU)Q1, Transcript of Mitochondrial arginine tRNA (tRNA-Arg), yeastyeast

Gene tR(UCU)Q1, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 VMR1P38735 1592 aa-6.76□□□□□ -3.49
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YML054C-AQ3E809 52 aa-6.76□□□□□ -3.49
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CSF1Q12150 2958 aa-6.8□□□□□ -3.5
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPO31P04051 1460 aa-6.84□□□□□ -3.5
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YDR034C-AP0C289 58 aa-6.97□□□□□ -3.53
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-7□□□□□ -3.53
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NUP159P40477 1460 aa-7.04□□□□□ -3.54
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YIL102C-AQ2V2P5 75 aa-7.07□□□□□ -3.54
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YOR316C-AQ3E806 69 aa-7.07□□□□□ -3.54
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PAI3P01094 68 aa-7.12□□□□□ -3.55
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PDR5P33302 1511 aaKnown RBP-7.2□□□□□ -3.56
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SCC2Q04002 1493 aa-7.2□□□□□ -3.56
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TRA1P38811 3744 aa-7.25□□□□□ -3.57
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP-7.26□□□□□ -3.57
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 FLO1P32768 1537 aa-7.27□□□□□ -3.57
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YPR010C-AA5Z2X5 72 aa-7.44□□□□□ -3.6
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SKI3P17883 1432 aaKnown RBP-7.55□□□□□ -3.62
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MYO4P32492 1471 aa-7.58□□□□□ -3.62
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 IRA1P18963 3092 aa-7.6□□□□□ -3.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YCF1P39109 1515 aaKnown RBP-7.62□□□□□ -3.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NUM1Q00402 2748 aa-7.64□□□□□ -3.63
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YBT1P32386 1661 aa-7.67□□□□□ -3.64
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SSK2P53599 1579 aa-7.74□□□□□ -3.65
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-7.8□□□□□ -3.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NUP188P52593 1655 aaKnown RBP-7.83□□□□□ -3.66
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 IRA2P19158 3079 aa-7.99□□□□□ -3.69
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-8.11□□□□□ -3.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YHR073W-AP0C5N7 58 aa-8.15□□□□□ -3.71
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 VMA9Q3E7B6 73 aa-8.24□□□□□ -3.73
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 GCN2P15442 1659 aa-8.26□□□□□ -3.73
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 STU1P38198 1513 aa-8.3□□□□□ -3.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 DDR2P89113 61 aa-8.32□□□□□ -3.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 BUD3P25558 1636 aa-8.34□□□□□ -3.74
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ATG2P53855 1592 aa-8.35□□□□□ -3.75
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YKL023C-AQ2V2P3 75 aa-8.38□□□□□ -3.75
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 COX9P07255 59 aa-8.4□□□□□ -3.75
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CDC25P04821 1589 aa-8.42□□□□□ -3.76
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 ULS1Q08562 1619 aa-8.5□□□□□ -3.77
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 VPS13Q07878 3144 aa-8.85□□□□□ -3.83
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YLR342W-AQ3E810 57 aa-8.86□□□□□ -3.83
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NUP170P38181 1502 aa-8.87□□□□□ -3.83
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YFR010W-AP0C5N0 62 aa-9.03□□□□□ -3.85
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NUP192P47054 1683 aa-9.05□□□□□ -3.86
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 USO1P25386 1790 aa-9.16□□□□□ -3.88
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 HIR3P47171 1648 aa-9.17□□□□□ -3.88
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PEP1P32319 1579 aa-9.21□□□□□ -3.88
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YJL127C-BQ3E828 52 aa-9.31□□□□□ -3.9
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SPT6P23615 1451 aaKnown RBP-9.72□□□□□ -3.96
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 PMP3P87284 55 aa-9.77□□□□□ -3.97
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RKR1Q04781 1562 aa-9.8□□□□□ -3.98
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 SMX2P40204 77 aaKnown RBP-9.85□□□□□ -3.99
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-10.37□□□□□ -4.07
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 HOR7Q05827 59 aa-10.56□□□□□ -4.1
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MON2P48563 1636 aaPredicted RBP-10.62□□□□□ -4.11
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 CHC1P22137 1653 aaKnown RBP-11.1□□□□□ -4.19
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 MLP2P40457 1679 aa-11.45□□□□□ -4.24
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TOM7P53507 60 aa-11.55□□□□□ -4.26
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 TOM1Q03280 3268 aa-11.85□□□□□ -4.31
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 NCE101Q02820 53 aa-12.71□□□□□ -4.44
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 RPL39P04650 51 aa-14.2□□□□□ -4.68
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 Q0297Q9ZZV8 51 aa-15.18□□□□□ -4.84
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-16.18□□□□□ -5
tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa-20.35□□□□□ -5.67
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 10 ms