RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeastyeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1YOL077C YPR117WQ06116 2489 aa-0.43□□□□□ -2.48
BRX1YOL077C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa-0.45□□□□□ -2.48
BRX1YOL077C MEC1P38111 2368 aa-0.46□□□□□ -2.48
BRX1YOL077C THO2P53552 1597 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
BRX1YOL077C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
BRX1YOL077C YBT1P32386 1661 aa-0.47□□□□□ -2.48
BRX1YOL077C YOR192C-CQ3E736 78 aa-0.48□□□□□ -2.49
BRX1YOL077C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
BRX1YOL077C YPR010C-AA5Z2X5 72 aa-0.5□□□□□ -2.49
BRX1YOL077C YOR316C-AQ3E806 69 aa-0.5□□□□□ -2.49
BRX1YOL077C DYN1P36022 4092 aa-0.5□□□□□ -2.49
BRX1YOL077C TEL1P38110 2787 aa-0.5□□□□□ -2.49
BRX1YOL077C BUD3P25558 1636 aa-0.52□□□□□ -2.49
BRX1YOL077C Q0017Q9ZZX8 53 aa-0.52□□□□□ -2.49
BRX1YOL077C SSK2P53599 1579 aa-0.54□□□□□ -2.5
BRX1YOL077C YFR010W-AP0C5N0 62 aa-0.55□□□□□ -2.5
BRX1YOL077C YDR034C-AP0C289 58 aa-0.56□□□□□ -2.5
BRX1YOL077C FLO1P32768 1537 aa-0.56□□□□□ -2.5
BRX1YOL077C CDC25P04821 1589 aa-0.57□□□□□ -2.5
BRX1YOL077C YML054C-AQ3E809 52 aa-0.57□□□□□ -2.5
BRX1YOL077C USO1P25386 1790 aa-0.59□□□□□ -2.5
BRX1YOL077C NUP192P47054 1683 aa-0.59□□□□□ -2.5
BRX1YOL077C ATG2P53855 1592 aa-0.6□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C STU1P38198 1513 aa-0.6□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C COX9P07255 59 aa-0.61□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C NUP170P38181 1502 aa-0.61□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C GCN2P15442 1659 aa-0.62□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C PEP1P32319 1579 aa-0.65□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C RKR1Q04781 1562 aa-0.66□□□□□ -2.51
BRX1YOL077C DDR2P89113 61 aa-0.67□□□□□ -2.52
BRX1YOL077C HIR3P47171 1648 aa-0.67□□□□□ -2.52
BRX1YOL077C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
BRX1YOL077C ULS1Q08562 1619 aa-0.69□□□□□ -2.52
BRX1YOL077C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
BRX1YOL077C CUP1-1P0CX80 61 aa-0.71□□□□□ -2.52
BRX1YOL077C CUP1-2P0CX81 61 aa-0.71□□□□□ -2.52
BRX1YOL077C YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-0.71□□□□□ -2.52
BRX1YOL077C YHR073W-AP0C5N7 58 aa-0.73□□□□□ -2.53
BRX1YOL077C YLR342W-AQ3E810 57 aa-0.75□□□□□ -2.53
BRX1YOL077C TRA1P38811 3744 aa-0.76□□□□□ -2.53
BRX1YOL077C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-0.78□□□□□ -2.53
BRX1YOL077C CSF1Q12150 2958 aa-0.79□□□□□ -2.54
BRX1YOL077C IRA1P18963 3092 aa-0.85□□□□□ -2.55
BRX1YOL077C SMX2P40204 77 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
BRX1YOL077C YJL127C-BQ3E828 52 aa-0.88□□□□□ -2.55
BRX1YOL077C NUM1Q00402 2748 aa-0.9□□□□□ -2.55
BRX1YOL077C PMP3P87284 55 aa-0.94□□□□□ -2.56
BRX1YOL077C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
BRX1YOL077C IRA2P19158 3079 aa-1.02□□□□□ -2.57
BRX1YOL077C HOR7Q05827 59 aa-1.05□□□□□ -2.58
BRX1YOL077C VPS13Q07878 3144 aa-1.09□□□□□ -2.58
BRX1YOL077C MLP2P40457 1679 aa-1.1□□□□□ -2.59
BRX1YOL077C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-1.18□□□□□ -2.6
BRX1YOL077C TOM7P53507 60 aa-1.2□□□□□ -2.6
BRX1YOL077C NCE101Q02820 53 aa-1.4□□□□□ -2.63
BRX1YOL077C TOM1Q03280 3268 aa-1.64□□□□□ -2.67
BRX1YOL077C RPL39P04650 51 aa-1.78□□□□□ -2.69
BRX1YOL077C Q0297Q9ZZV8 51 aa-2.05□□□□□ -2.74
BRX1YOL077C YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-2.12□□□□□ -2.75
BRX1YOL077C YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa-2.93□□□□□ -2.88
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.7 ms