RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K UBX2Q04228 584 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K CSI1Q04368 295 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K TYW1Q08960 810 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K SRF1Q12516 437 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K LYS2P07702 1392 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.24□□□□□ -1.89not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K ASH1P34233 588 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K TFA1P36100 482 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K RSC30P38781 883 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K NUG1P40010 520 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K UTP7P40055 554 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K YFH7P43591 353 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K CST9Q06032 482 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K SGD1Q06132 899 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K WRS1Q12109 432 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K RRI2Q12348 645 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K TOM1Q03280 3268 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K POM152P39685 1337 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K AI2P03876 854 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K GAL2P13181 574 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K DAL5P15365 543 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K FAS2P19097 1887 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K MDL2P33311 773 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K MOT2P34909 587 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K PTK1P36002 662 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K YBL028CP38202 106 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K TPS3P38426 1054 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K MTC5Q03897 1148 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K RBA50Q04418 439 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K INM2Q05533 292 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K PMA1P05030 918 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K ADP1P25371 1049 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K IXR1P33417 597 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K FUN12P39730 1002 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K BOI2P39969 1040 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K YPP1P46951 817 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL171CP46992 396 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL193WP53870 558 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K GIN4Q12263 1142 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K SAC3P46674 1301 aa3.21□□□□□ -1.89
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD53P22216 821 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K HAL5P38970 855 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K ACA1P39970 489 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K NSG2P53898 299 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K RPN7Q06103 429 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PSF3Q12146 194 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K GYP5Q12344 894 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K ADR1P07248 1323 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K FBP1P09201 348 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K KRS1P15180 591 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K YDJ1P25491 409 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K GLO3P38682 493 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS27P40343 622 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PSF2P40359 213 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K SPR3P41901 512 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K APL6P46682 809 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K ULP1Q02724 621 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PPM2Q08282 695 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K UTP10P42945 1769 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K TUB2P02557 457 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS19AP07280 144 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PAH1P32567 862 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K MCD4P36051 919 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K BOI1P38041 980 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K GRX7P38068 203 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PIP2P52960 996 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG1P53104 897 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO1P53541 631 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K RMD1Q03441 430 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC45Q08032 650 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K SNF3P10870 884 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K SRS2P12954 1174 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K OCT1P35999 772 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K YKR023WP36119 530 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K ERG7P38604 731 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K YIL092WP40497 633 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K BDP1P46678 594 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL007CP47080 104 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K AAD16Q02895 342 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K PUF6Q04373 656 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K LAP2Q10740 671 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K RPP0P05317 312 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD2P07276 1031 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K ACE2P21192 770 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K KTR3P38130 404 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K MAL31P38156 614 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K SSF1P38789 453 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K ILV3P39522 585 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)KtW(CCA)K LYS14P40971 790 aa3.17□□□□□ -1.9
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