RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	RSC6	P25632	483 aa		3.53	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	KAP122	P32767	1081 aa		3.53	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	SFA1	P32771	386 aa		3.53	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	APM2	P38700	605 aa		3.53	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	RIM21	P48565	533 aa		3.53	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
snR46	snR46	CHS2	P14180	963 aa		3.52	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	TOS1	P38288	455 aa		3.52	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	YKR073C	P36153	106 aa		3.51	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	SKP1	P52286	194 aa		3.51	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	YGR130C	P53278	816 aa		3.51	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	YNR040W	P53736	256 aa		3.51	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	YLR122C	Q12312	125 aa		3.51	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	not detected
snR46	snR46	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	BRE4	Q07660	1125 aa		3.49	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	SCD5	P34758	872 aa		3.48	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	SAF1	P38352	637 aa		3.48	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	AKR1	P39010	764 aa		3.48	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	KTR7	P40504	517 aa		3.48	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	SLP1	Q12232	587 aa		3.48	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		3.47	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	MRP10	O75012	95 aa		3.47	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	TED1	P40533	473 aa		3.47	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	AOS1	Q06624	347 aa		3.47	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		3.47	□□□□□ -1.85
snR46	snR46	CYC7	P00045	113 aa		3.46	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	LEU3	P08638	886 aa		3.46	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	GIP2	P40036	548 aa		3.46	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	QDR2	P40474	542 aa		3.46	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	CTH1	P47976	325 aa		3.46	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	DSE4	P53753	1117 aa		3.46	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	UBP5	P39944	805 aa		3.45	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	MRX10	Q05648	414 aa		3.45	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	HAP4	P14064	554 aa		3.44	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	IDI1	P15496	288 aa		3.44	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.44	□□□□□ -1.86	not detected
snR46	snR46	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	RPC31	P17890	251 aa		3.43	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	PHO87	P25360	923 aa		3.43	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	HXT5	P38695	592 aa		3.43	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	BIM1	P40013	344 aa		3.43	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	SPO74	P45819	413 aa		3.43	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	YJL181W	P46987	611 aa		3.43	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	ELM1	P32801	640 aa		3.42	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	CWH41	P53008	833 aa		3.42	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	ITC1	P53125	1264 aa		3.42	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	GAS4	Q08271	471 aa		3.42	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	RNQ1	P25367	405 aa		3.41	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	ATG32	P40458	529 aa		3.41	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	RSC2	Q06488	889 aa		3.41	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	REC8	Q12188	680 aa		3.41	□□□□□ -1.86
snR46	snR46	VAN1	P23642	535 aa		3.4	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	UBP1	P25037	809 aa		3.4	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	PEP12	P32854	288 aa		3.4	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	GIP1	P38229	639 aa		3.38	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	DYS1	P38791	387 aa		3.38	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	YOR296W	Q08748	1289 aa		3.38	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	VMA3	P25515	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	YKL222C	P35995	705 aa		3.37	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	LDH1	P38139	375 aa		3.37	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	PPT1	P53043	513 aa		3.37	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	SEG2	P34250	1132 aa		3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	ISW1	P38144	1129 aa		3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	BSD2	P38356	321 aa		3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	PAN5	P38787	379 aa		3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	ROM1	P53046	1155 aa		3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	SDH1	Q00711	640 aa		3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	TRS33	Q99394	268 aa		3.36	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	GAL2	P13181	574 aa		3.35	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	LEM3	P42838	414 aa		3.35	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	MRPL33	P20084	86 aa		3.34	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	LRG1	P35688	1017 aa		3.34	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	YBR287W	P38355	427 aa		3.34	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	YIL165C	P40446	119 aa		3.34	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	GUP1	P53154	560 aa		3.34	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	NSI1	Q12457	570 aa		3.34	□□□□□ -1.87
snR46	snR46	ECL1	P48235	211 aa		3.33	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	CAB1	Q04430	367 aa		3.33	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	GIC2	Q06648	383 aa		3.33	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	SIS2	P36024	562 aa		3.32	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 829.5 ms