RNA–Protein interactions for RNA: YPR083W

MDM36, Transcript of Mitochondrial protein, yeast

Gene MDM36, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM36	YPR083W	MCM1	P11746	286 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	MGE1	P38523	228 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	ACO2	P39533	789 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	YJR107W	P47145	328 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	CAF120	P53836	1060 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	YNL165W	P53891	406 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	SCD5	P34758	872 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	MET1	P36150	593 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	VTC4	P47075	721 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	VMA3	P25515	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	UFD2	P54860	961 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	OSH7	P38755	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	FYV10	P40492	516 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	MLF3	P32047	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	DAL1	P32375	460 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	SSN3	P39073	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	HXT8	P40886	569 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	MCM2	P29469	868 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	YIR007W	P40566	764 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	DAK2	P43550	591 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	MSN5	P52918	1224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	QDR2	P40474	542 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	YNL011C	P53980	444 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	SPR28	Q04921	423 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	LDH1	P38139	375 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	ROG3	P43602	733 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	CDC55	Q00362	526 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	SMC1	P32908	1225 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	JJJ2	P46997	583 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	SVF1	Q05515	481 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	AIM44	Q99299	758 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM36	YPR083W	MSN1	P22148	382 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	DYS1	P38791	387 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	RAD55	P38953	406 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	RGD2	P43556	714 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	TOS4	Q06266	489 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	SLA1	P32790	1244 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	SAM37	P50110	327 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	RSC4	Q02206	625 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	IRE1	P32361	1115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
MDM36	YPR083W	KAP122	P32767	1081 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	VPS35	P34110	944 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	FIR1	P40020	876 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	UBP15	P50101	1230 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	MTO1	P53070	669 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	BSC2	Q05611	235 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	CCP1	P00431	361 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	PEP7	P32609	515 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	BSD2	P38356	321 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	YTA6	P40328	754 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	NTA1	P40354	457 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	PSH1	Q12161	406 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	PSY2	P40164	858 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	YGR035C	P53222	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	OXR1	Q08952	273 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	RPC31	P17890	251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	GIP1	P38229	639 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	OCA5	P38738	679 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	HPF1	Q05164	967 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	ISW1	P38144	1129 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	FAA3	P39002	694 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	YGR122W	P53272	402 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	CUZ1	P53899	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MDM36	YPR083W	CYC8	P14922	966 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	TRK2	P28584	889 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	YHL008C	P38750	627 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	MAD1	P40957	749 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	DAL4	Q04895	635 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	VAC8	P39968	578 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	ALD3	P54114	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MDM36	YPR083W	VPS16	Q03308	798 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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