RNA–Protein interactions for RNA: YOR247W

SRL1, Transcript of Mannoprotein that exhibits a tight association with the cell wall, yeast

Gene SRL1, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cellular bud, Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRL1	YOR247W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SRL1	YOR247W	SUM1	P46676	1062 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRL1	YOR247W	CAF120	P53836	1060 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRL1	YOR247W	CAB1	Q04430	367 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SRL1	YOR247W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	MRPL33	P20084	86 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	SMC1	P32908	1225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	SAM37	P50110	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	YNL011C	P53980	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	STB3	Q12427	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	VPS35	P34110	944 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	MET1	P36150	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	YBR287W	P38355	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	HXT5	P38695	592 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	SSN3	P39073	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	FIR1	P40020	876 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	NNF1	P47149	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	UBP15	P50101	1230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	OXR1	Q08952	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	LDH1	P38139	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	RGA1	P39083	1007 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	YIR007W	P40566	764 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	HXT8	P40886	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	ROG3	P43602	733 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	CDC55	Q00362	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	RMD1	Q03441	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	RPB10	P22139	70 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	DYS1	P38791	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	JJJ2	P46997	583 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	MNL2	Q12205	849 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	VMA3	P25515	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	YTA6	P40328	754 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	MAD1	P40957	749 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	DAK2	P43550	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	YTA7	P40340	1379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	CLN2	P20438	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	IRE1	P32361	1115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	PEP7	P32609	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	SLA1	P32790	1244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	OCA5	P38738	679 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	YGR035C	P53222	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRL1	YOR247W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	RAD55	P38953	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	LYS5	P50113	272 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	RSC4	Q02206	625 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	BSC2	Q05611	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	MCM2	P29469	868 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	FYV10	P40492	516 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	YGR122W	P53272	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	DPH6	Q12429	685 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	DIT1	P21623	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	KAP122	P32767	1081 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	CEM1	P39525	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	NTA1	P40354	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	QDR2	P40474	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	SPR28	Q04921	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	MLF3	P32047	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	KTR2	P33550	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	MNR2	P35724	969 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	ISW1	P38144	1129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	CUZ1	P53899	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	HPF1	Q05164	967 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	PIN2	Q12057	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	CCP1	P00431	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	MSN1	P22148	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	TRK2	P28584	889 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	PET112	P33893	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	GIP1	P38229	639 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	PSY2	P40164	858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	YNL165W	P53891	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	PSH1	Q12161	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRL1	YOR247W	CYC8	P14922	966 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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