RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	UGA3	P26370	528 aa		5.54	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	SEC8	P32855	1065 aa		5.54	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	RSC30	P38781	883 aa		5.54	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	MDJ2	P42834	146 aa		5.54	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	YGL081W	P53156	320 aa		5.54	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	KAR5	Q04746	504 aa		5.54	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	GIN4	Q12263	1142 aa		5.54	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	ARG8	P18544	423 aa		5.53	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	ATG1	P53104	897 aa		5.53	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	STB3	Q12427	513 aa		5.53	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	STU1	P38198	1513 aa		5.53	□□□□□ -1.52
RPS1B	YML063W	YOR1	P53049	1477 aa		5.52	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	GAL2	P13181	574 aa		5.52	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	VAC17	P25591	423 aa		5.52	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	PPG1	P32838	368 aa		5.52	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	ACF4	P47129	309 aa		5.52	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	LTE1	P07866	1435 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	ECM23	Q02710	187 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	RMD1	Q03441	430 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	OPT2	Q06593	877 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	TPO2	P53283	614 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	WHI5	Q12416	295 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	UBX7	P38349	436 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	ACO2	P39533	789 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	ALG12	P53730	551 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	TRM732	Q03496	1420 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	SMC4	Q12267	1418 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	VTH1	P40438	1549 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	VTH2	P40890	1549 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.48	□□□□□ -1.53	not detected
RPS1B	YML063W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	RTT106	P40161	455 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	THI12	P42883	340 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	THI5	P43534	340 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	NUP85	P46673	744 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	THI11	P47183	340 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	CAF120	P53836	1060 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	THI13	Q07748	340 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	SRF1	Q12516	437 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	SPP41	P38904	1435 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	NUP159	P40477	1460 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	CIT2	P08679	460 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	CLN2	P20438	545 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	YBL086C	P38177	466 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	TPM2	P40414	161 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	RPN4	Q03465	531 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
RPS1B	YML063W	SRS2	P12954	1174 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	TSR4	P25040	408 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	NSE3	Q05541	303 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	MNL2	Q12205	849 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	MCM16	Q12262	181 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	VPS15	P22219	1454 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	HAP4	P14064	554 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	PHO87	P25360	923 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	MET1	P36150	593 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	VAC8	P39968	578 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	ATG3	P40344	310 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
RPS1B	YML063W	PNP1	Q05788	311 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	NUT2	Q06213	157 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	PIN2	Q12057	282 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	IRC20	Q06554	1556 aa		5.45	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	BUD6	P41697	788 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	AAD14	P42884	376 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	IOC3	P43596	787 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	APP1	P53933	587 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	ALD3	P54114	506 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	SPO14	P36126	1683 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	MET4	P32389	672 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	KTR7	P40504	517 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	MAD1	P40957	749 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	FIG4	P42837	879 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.43	□□□□□ -1.54	not detected
RPS1B	YML063W	VPS16	Q03308	798 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.43	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	TSC11	P40061	1430 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	MIP1	P15801	1254 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	GRX4	P32642	244 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	YIR007W	P40566	764 aa		5.42	□□□□□ -1.54

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