RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeastyeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTR2YKR093W OXR1Q08952 273 aa7.47□□□□□ -1.21
PTR2YKR093W MCM1P11746 286 aa7.46□□□□□ -1.21
PTR2YKR093W CIC1P38779 376 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PTR2YKR093W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTR2YKR093W WTM2Q12206 467 aa7.46□□□□□ -1.21
PTR2YKR093W TOP1P04786 769 aa7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W SMC1P32908 1225 aa7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W MKS1P34072 584 aa7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data7.45□□□□□ -1.22not detected
PTR2YKR093W UBP9P39967 754 aa7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W ATG36P46983 293 aa7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W BDF2Q07442 638 aa7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W STE6P12866 1290 aa7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W SCD5P34758 872 aa7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W TAT2P38967 592 aa7.45□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W VMA3P25515 160 aa7.44□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W HXT8P40886 569 aa7.44□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W BSC2Q05611 235 aa7.44□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W PUS5Q06244 254 aa7.44□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W CWC24P53769 259 aa7.43□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data7.43□□□□□ -1.22not detected
PTR2YKR093W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W FKH1P40466 484 aa7.42□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W SAS4Q04003 481 aa7.41□□□□□ -1.22
PTR2YKR093W GRX1P25373 110 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W RAD55P38953 406 aa7.4□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W UTP7P40055 554 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W SUM1P46676 1062 aa7.4□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W DFG5Q05031 458 aa7.4□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W YOR131CQ12486 218 aa7.4□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W YJR008WP47085 338 aa7.39□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W FAA4P47912 694 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W DAL4Q04895 635 aa7.39□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W INP54Q08227 384 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W PRE9P23638 258 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W YBL086CP38177 466 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W RGD2P43556 714 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W BDP1P46678 594 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W GDE1Q02979 1223 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W GYP1Q08484 637 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W TSR4P25040 408 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W LDH1P38139 375 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W YHL008CP38750 627 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W NTA1P40354 457 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W MCD1Q12158 566 aa7.38□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W CDC34P14682 295 aa7.37□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W MRPS18P42847 217 aa7.37□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W HUL5P53119 910 aa7.37□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W YNL165WP53891 406 aa7.37□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W POB3Q04636 552 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W UBX5Q06682 500 aa7.37□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W PRP40P33203 583 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W PPM2Q08282 695 aa7.36□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W Q0182Q9ZZW1 134 aa7.36□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W MSN1P22148 382 aa7.36□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W DUT1P33317 147 aa7.36□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W IRS4P36115 615 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W PRE3P38624 215 aa7.35□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W DYS1P38791 387 aa7.35□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W PSY2P40164 858 aa7.35□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W RTS3P53289 263 aa7.35□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W YCS4Q06156 1176 aa7.35□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W RAD4P14736 754 aa7.34□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W PRI2P20457 528 aa7.34□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W TOM20P35180 183 aa7.34□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W QDR2P40474 542 aa7.34□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W YGR053CP53234 283 aa7.34□□□□□ -1.23
PTR2YKR093W FLP1P03870 423 aa7.34□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W MLF3P32047 452 aa7.34□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W UGA4P32837 571 aa7.34□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W YPL109CQ02981 657 aa7.34□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W OPI10Q08202 246 aa7.34□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W SDH2P21801 266 aa7.33□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W MCM5P29496 775 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W MNN1P39106 762 aa7.33□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W FIR1P40020 876 aa7.33□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W NUP82P40368 713 aa7.33□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W MET6P05694 767 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W YKL069WP36088 180 aa7.32□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W NUG1P40010 520 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W DLD3P39976 496 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W TIM54P47045 478 aa7.31□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W YJR142WP47173 342 aa7.31□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W GRX4P32642 244 aa7.3□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W TIM23P32897 222 aa7.3□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W PIC2P40035 300 aa7.3□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W SSB1P11484 613 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTR2YKR093W KAR2P16474 682 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.4 ms