RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	HEH2	Q03281	663 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	AI1	P03875	834 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	RPC31	P17890	251 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	LDH1	P38139	375 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	YBR287W	P38355	427 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	APM2	P38700	605 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	MSC7	P38694	644 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YJR087W	YJR087W	GIP1	P38229	639 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	ICP55	P40051	511 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	THI72	Q08579	599 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	YOR296W	Q08748	1289 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	PHM7	Q12252	991 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	LSO1	Q3E827	93 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	MET1	P36150	593 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	GEF1	P37020	779 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	ISW1	P38144	1129 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	FIR1	P40020	876 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	NSG2	P53898	299 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	HXT8	P40886	569 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	YNR040W	P53736	256 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	KAR5	Q04746	504 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	APC11	Q12157	165 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	MDJ1	P35191	511 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	BSD2	P38356	321 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	BOL3	P39724	118 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	PRK1	P40494	810 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	ITC1	P53125	1264 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	YNR014W	P53719	212 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	MSN1	P22148	382 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	YFL066C	P43538	392 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	RSC2	Q06488	889 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YJR087W	YJR087W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.58	□□□□□ -1.52	not detected
YJR087W	YJR087W	SMC1	P32908	1225 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	BOI2	P39969	1040 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	IDI1	P15496	288 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	AIM46	P38885	310 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	NTA1	P40354	457 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	YIL165C	P40446	119 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	ATG1	P53104	897 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	RPB10	P22139	70 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	ALG14	P38242	237 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	RAD55	P38953	406 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	QDR1	P40475	563 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	TDA6	Q06466	467 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	NHA1	Q99271	985 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	RGD2	P43556	714 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	ACF4	P47129	309 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	YMR187C	Q03236	431 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	KTR2	P33550	425 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	PPT1	P53043	513 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	UFD2	P54860	961 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	GIS4	Q04233	774 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	HAT1	Q12341	374 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YJR087W	YJR087W	SLP1	Q12232	587 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	PSY2	P40164	858 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	YJL181W	P46987	611 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	MRP10	O75012	95 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	ERP5	P38819	212 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	SKN7	P38889	622 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	TRS120	Q04183	1289 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	FUS1	P11710	512 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	LEM3	P42838	414 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	GUP1	P53154	560 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YJR087W	YJR087W	TAT1	P38085	619 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	GIP2	P40036	548 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	MDJ2	P42834	146 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	YNL011C	P53980	444 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	RSC4	Q02206	625 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	YDR215C	Q12240	137 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YJR087W	YJR087W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54

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