RNA–Protein interactions for RNA: YER003C

PMI40, Transcript of Mannose-6-phosphate isomerase, yeast

Gene PMI40, Length 1,290 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMI40	YER003C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PMI40	YER003C	MGE1	P38523	228 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PMI40	YER003C	OSH7	P38755	437 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PMI40	YER003C	SSN3	P39073	555 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PMI40	YER003C	DAL1	P32375	460 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	SEC8	P32855	1065 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	SCD5	P34758	872 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	SPR3	P41901	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	DPH6	Q12429	685 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	FRT1	Q99332	602 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	JJJ2	P46997	583 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	YJR107W	P47145	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	STB3	Q12427	513 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	MET4	P32389	672 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	OCA5	P38738	679 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	YBR197C	P38306	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	HXT5	P38695	592 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	YTA6	P40328	754 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	NSG2	P53898	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	TRS120	Q04183	1289 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	CAB1	Q04430	367 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	PHM7	Q12252	991 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	YTA7	P40340	1379 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	IRE1	P32361	1115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	JJJ3	P47138	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	APC11	Q12157	165 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	ISC10	P32645	267 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	SLA1	P32790	1244 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	NNF1	P47149	201 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	UBP15	P50101	1230 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
PMI40	YER003C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PMI40	YER003C	LYS5	P50113	272 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	UFD2	P54860	961 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	MRPL33	P20084	86 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	MLF3	P32047	452 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	MET1	P36150	593 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	YNL165W	P53891	406 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	GPI13	Q07830	1017 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	RMD1	Q03441	430 aa		5	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	THI72	Q08579	599 aa		5	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	MNL2	Q12205	849 aa		5	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	DYS1	P38791	387 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	YFL066C	P43538	392 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	PSH1	Q12161	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	VMA3	P25515	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	VPS35	P34110	944 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	LDH1	P38139	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	FYV10	P40492	516 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	RPB10	P22139	70 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	KAP122	P32767	1081 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	QDR2	P40474	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	DAK2	P43550	591 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	MTO1	P53070	669 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	YNL011C	P53980	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	CDC55	Q00362	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PMI40	YER003C	YBR287W	P38355	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	SAM37	P50110	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	RGP1	P16664	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	SMC1	P32908	1225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	KTR2	P33550	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	HXT8	P40886	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	CUZ1	P53899	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	RSC4	Q02206	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	RPC31	P17890	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	MCM2	P29469	868 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	FIR1	P40020	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	MAD1	P40957	749 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	DOS2	P54858	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	SPR28	Q04921	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	AI1	P03875	834 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	CLN2	P20438	545 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	DIT1	P21623	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	MRPL16	P38064	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	ISW1	P38144	1129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	SKP1	P52286	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	YGR122W	P53272	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMI40	YER003C	VPS16	Q03308	798 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.6 ms