RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-215ENST00000612980 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.35□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.35□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 ADGRB2O60241 1585 aa7.34□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 A0A0G2JS52 829 aa7.34□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 MYT1Q01538 1121 aa7.34□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 ORAI2Q96SN7 254 aa7.34□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 UTRNP46939 3433 aa7.34□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 NOS1P29475 1434 aa7.34□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.34□□□□□ -1.23
RDM1-215ENST00000612980 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.34□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 USP32Q8NFA0 1604 aa7.34□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 HSPA6P17066 643 aa7.33□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 TBX22Q9Y458 520 aa7.33□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.32□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.32□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 PXDNQ92626 1479 aa7.31□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 NRAPQ86VF7 1730 aa7.31□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 TNS4Q8IZW8 715 aa7.31□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.31□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.3□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 TRIM37O94972 964 aa7.3□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 PTGER2P43116 358 aa7.3□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 VPS72Q15906 364 aa7.3□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 SYT17Q9BSW7 474 aa7.3□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.3□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.3□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 DLC1Q96QB1 1528 aa7.29□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 ZBTB7AO95365 584 aa7.29□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 PIK3R4Q99570 1358 aa7.29□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 ABCA3Q99758 1704 aa7.29□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.29□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.28□□□□□ -1.24
RDM1-215ENST00000612980 PLEKHG5O94827 1062 aa7.27□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 APBA3O96018 575 aa7.27□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 ADGRL2O95490 1459 aa7.27□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 ATP10DQ9P241 1426 aa7.27□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.26□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 CEP162Q5TB80 1403 aa7.26□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.25□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 METP08581 1390 aa7.24□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 FAM83GA6ND36 823 aa7.24□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.24□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 NBPF14Q5TI25 921 aa7.24□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.24□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 TNS2Q63HR2 1409 aa7.24□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.23□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.23□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.23□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 WDR90Q96KV7 1748 aa7.22□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 HTRA3P83110 453 aa7.22□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 GPR162Q16538 588 aa7.22□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.22□□□□□ -1.25
RDM1-215ENST00000612980 FOXO3O43524 673 aa7.21□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.21□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 TSPY4P0CV99 314 aa7.2□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 TSPY10P0CW01 314 aa7.2□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.2□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.2□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.19□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.19□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.19□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 KIF15Q9NS87 1388 aa7.19□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 ERBINQ96RT1 1412 aa7.18□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 FAM161AQ3B820 660 aa7.18□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.18□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.18□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 ADCY9O60503 1353 aa7.18□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 NUTM2FA1L443 756 aa7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 APLP1P51693 650 aa7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 MAP3K5Q99683 1374 aa7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 ABCC5O15440 1437 aa7.17□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 KIF3CO14782 793 aa7.16□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.16□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 KLHL34Q8N239 644 aa7.16□□□□□ -1.26
RDM1-215ENST00000612980 JMYQ8N9B5 988 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms