RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EP400Q96L91 3159 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYOM2P54296 1465 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HFM1A2PYH4 1435 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CLTCL1P53675 1640 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FOXO3O43524 673 aa23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF1BO60333 1816 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PXDNQ92626 1479 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.39■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUTM2FA1L443 756 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GLI3P10071 1580 aa23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLIT2O94813 1529 aa23.37■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NAIPQ13075 1403 aa23.34■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRP5O75197 1615 aa23.33■■□□□ 1.33
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.33■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STK26Q9P289 416 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A0G2JS52 829 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BAG6P46379 1132 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYT1Q01538 1121 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VPS72Q15906 364 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP32Q8NFA0 1604 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHG5O94827 1062 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPLO60437 1756 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HRCP23327 699 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PSME1Q06323 249 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF1AQ12756 1690 aa23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TECPR2O15040 1411 aa23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.2■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC11Q96J66 1382 aa23.19■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.19■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.19■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.19■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.18■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.18■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RGL3Q3MIN7 710 aa23.17■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGEF10O15013 1369 aa23.16■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SBNO1A3KN83 1393 aa23.14■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.14■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM83GA6ND36 823 aa23.13■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.13■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BTG4Q9NY30 223 aa23.12■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM182BQ5T319 152 aa23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SIRT1Q96EB6 747 aa23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.08■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCA3Q99758 1704 aa23.08■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIK3C2GO75747 1445 aa23.07■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IFT172Q9UG01 1749 aa23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NRAPQ86VF7 1730 aa23.03■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.03■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DISP2A7MBM2 1401 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 YY1P25490 414 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRAM1Q96QH2 718 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POGKQ9P215 609 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGRB2O60241 1585 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.98■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIM37O94972 964 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.97■■□□□ 1.27
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