RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TECPR2O15040 1411 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-212ENST00000591041 LTKP29376 864 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-212ENST00000591041 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3R4Q99570 1358 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-212ENST00000591041 METP08581 1390 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CPS1P31327 1500 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MED14O60244 1454 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TMC1Q8TDI8 760 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MYOM1P52179 1685 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MRS2Q9HD23 443 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PARD3Q8TEW0 1356 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PTCH1Q13635 1447 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK19Q9BWU1 502 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-212ENST00000591041 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP13Q86W25 1043 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CABP2Q9NPB3 220 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-212ENST00000591041 NSD2O96028 1365 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRB2O60241 1585 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 USP32Q8NFA0 1604 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP7BP35670 1465 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-212ENST00000591041 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRUQ92729 1446 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MORC1Q86VD1 984 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PIP4K2BP78356 416 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CABP1Q9NZU7 370 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PP64 1363 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNA6P17658 529 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP2R1AP30153 589 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TOM1O60784 492 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPA1LP34931 641 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 INSRP06213 1382 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC184Q52MB2 194 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ITSN1Q15811 1721 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP53Q96M91 514 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-212ENST00000591041 NWD1Q149M9 1564 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-212ENST00000591041 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-212ENST00000591041 C14orf37Q86TY3 774 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 AKAP12Q02952 1782 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.2■■■□□ 2.43
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