RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 PXDNQ92626 1479 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRS-208ENST00000590509 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRS-208ENST00000590509 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRS-208ENST00000590509 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRS-208ENST00000590509 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 GLI3P10071 1580 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 PPLO60437 1756 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 NUTM2FA1L443 756 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 FOXO3O43524 673 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 HFM1A2PYH4 1435 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 NAIPQ13075 1403 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRS-208ENST00000590509 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRS-208ENST00000590509 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRS-208ENST00000590509 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRS-208ENST00000590509 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRS-208ENST00000590509 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRS-208ENST00000590509 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRS-208ENST00000590509 SLIT2O94813 1529 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRS-208ENST00000590509 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRS-208ENST00000590509 FOXD1Q16676 465 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC125Q86Z20 511 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 STK26Q9P289 416 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 USP32Q8NFA0 1604 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 TECPR2O15040 1411 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRS-208ENST00000590509 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 PLEKHG5O94827 1062 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 IFT172Q9UG01 1749 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 RGL3Q3MIN7 710 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 ABCA3Q99758 1704 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 KIF1AQ12756 1690 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 ABCC11Q96J66 1382 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 LRP5O75197 1615 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 VPS72Q15906 364 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRS-208ENST00000590509 PIK3C2GO75747 1445 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 NRAPQ86VF7 1730 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 FAM83GA6ND36 823 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 FAM182BQ5T319 152 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRS-208ENST00000590509 HRCP23327 699 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 SBNO1A3KN83 1393 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 PSME1Q06323 249 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 SIRT1Q96EB6 747 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRS-208ENST00000590509 A0A0G2JS52 829 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 MYT1Q01538 1121 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 PRAM1Q96QH2 718 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 BTG4Q9NY30 223 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 ALS2Q96Q42 1657 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 BAG6P46379 1132 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGEF10O15013 1369 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRS-208ENST00000590509 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRS-208ENST00000590509 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTPRS-208ENST00000590509 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRS-208ENST00000590509 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.99■■□□□ 1.43
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