RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 TECPR2O15040 1411 aa30.85■■■□□ 2.53
PPP4C-211ENST00000567642 ABCC11Q96J66 1382 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP4C-211ENST00000567642 LAMC1P11047 1609 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP4C-211ENST00000567642 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
PPP4C-211ENST00000567642 MYOM2P54296 1465 aa30.82■■■□□ 2.53
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.81■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.79■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 NUTM2FA1L443 756 aa30.78■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
PPP4C-211ENST00000567642 HRCP23327 699 aa30.76■■■□□ 2.51
PPP4C-211ENST00000567642 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.74■■■□□ 2.51
PPP4C-211ENST00000567642 AFF2P51816 1311 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP4C-211ENST00000567642 C8orf37Q96NL8 207 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP4C-211ENST00000567642 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP4C-211ENST00000567642 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP4C-211ENST00000567642 SIRT1Q96EB6 747 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP4C-211ENST00000567642 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
PPP4C-211ENST00000567642 FOXO3O43524 673 aa30.69■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 ADAMTS2O95450 1211 aa30.69■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.69■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.67■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 RXRBP28702 533 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 PRAM1Q96QH2 718 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 PXDNQ92626 1479 aa30.64■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 NGLY1Q96IV0 654 aa30.64■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 POGKQ9P215 609 aa30.64■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 KIF1AQ12756 1690 aa30.64■■■□□ 2.5
PPP4C-211ENST00000567642 DLC1Q96QB1 1528 aa30.61■■■□□ 2.49
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRB1O14514 1584 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-211ENST00000567642 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-211ENST00000567642 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-211ENST00000567642 STAC3Q96MF2 364 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-211ENST00000567642 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-211ENST00000567642 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-211ENST00000567642 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-211ENST00000567642 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PPP4C-211ENST00000567642 USP21Q9UK80 565 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP4C-211ENST00000567642 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRB2O60241 1585 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 USP32Q8NFA0 1604 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 PSME1Q06323 249 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-211ENST00000567642 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.45■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 RGS12O14924 1447 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHG5O94827 1062 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.4■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP4C-211ENST00000567642 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 ATRNO75882 1429 aa30.38■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 SBNO1A3KN83 1393 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.35■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.35■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.35■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 ITSN1Q15811 1721 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 ABCA3Q99758 1704 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF10O15013 1369 aa30.32■■■□□ 2.44
PPP4C-211ENST00000567642 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.31■■■□□ 2.44
PPP4C-211ENST00000567642 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.29■■■□□ 2.44
PPP4C-211ENST00000567642 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
PPP4C-211ENST00000567642 SLIT2O94813 1529 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-211ENST00000567642 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-211ENST00000567642 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-211ENST00000567642 ALS2Q96Q42 1657 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-211ENST00000567642 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 CDK19Q9BWU1 502 aa30.25■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 ATP7BP35670 1465 aa30.24■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.23■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.23■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.22■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 NEUROD1Q13562 356 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4C-211ENST00000567642 GLI3P10071 1580 aa30.19■■■□□ 2.42
PPP4C-211ENST00000567642 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.19■■■□□ 2.42
PPP4C-211ENST00000567642 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.17■■■□□ 2.42
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
PPP4C-211ENST00000567642 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.16■■■□□ 2.42
PPP4C-211ENST00000567642 FAM83GA6ND36 823 aa30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms