RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566914.1

KIFC3-227, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 3

Gene KIFC3, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-227	ENST00000566914	TECPR2	O15040	1411 aa		32.71	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.7	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	LAMC1	P11047	1609 aa		32.7	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.69	■■■□□ 2.82
KIFC3-227	ENST00000566914	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.68	■■■□□ 2.82
KIFC3-227	ENST00000566914	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.67	■■■□□ 2.82
KIFC3-227	ENST00000566914	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.66	■■■□□ 2.82
KIFC3-227	ENST00000566914	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
KIFC3-227	ENST00000566914	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
KIFC3-227	ENST00000566914	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.63	■■■□□ 2.81
KIFC3-227	ENST00000566914	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.62	■■■□□ 2.81
KIFC3-227	ENST00000566914	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.61	■■■□□ 2.81
KIFC3-227	ENST00000566914	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.6	■■■□□ 2.81
KIFC3-227	ENST00000566914	HRC	P23327	699 aa		32.6	■■■□□ 2.81
KIFC3-227	ENST00000566914	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-227	ENST00000566914	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.57	■■■□□ 2.8
KIFC3-227	ENST00000566914	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.56	■■■□□ 2.8
KIFC3-227	ENST00000566914	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
KIFC3-227	ENST00000566914	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-227	ENST00000566914	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
KIFC3-227	ENST00000566914	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
KIFC3-227	ENST00000566914	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.51	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.51	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	AFF2	P51816	1311 aa		32.51	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.5	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.5	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	FOXO3	O43524	673 aa		32.49	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.49	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	PXDN	Q92626	1479 aa		32.48	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.46	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	POGK	Q9P215	609 aa		32.46	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.46	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.46	■■■□□ 2.79
KIFC3-227	ENST00000566914	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
KIFC3-227	ENST00000566914	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
KIFC3-227	ENST00000566914	RXRB	P28702	533 aa		32.38	■■■□□ 2.77
KIFC3-227	ENST00000566914	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.38	■■■□□ 2.77
KIFC3-227	ENST00000566914	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.37	■■■□□ 2.77
KIFC3-227	ENST00000566914	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.36	■■■□□ 2.77
KIFC3-227	ENST00000566914	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
KIFC3-227	ENST00000566914	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
KIFC3-227	ENST00000566914	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
KIFC3-227	ENST00000566914	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.34	■■■□□ 2.77
KIFC3-227	ENST00000566914	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-227	ENST00000566914	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-227	ENST00000566914	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-227	ENST00000566914	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.29	■■■□□ 2.76
KIFC3-227	ENST00000566914	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32.28	■■■□□ 2.76
KIFC3-227	ENST00000566914	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.27	■■■□□ 2.76
KIFC3-227	ENST00000566914	USP21	Q9UK80	565 aa		32.26	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.26	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.26	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.24	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.23	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	RGS12	O14924	1447 aa		32.23	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	PSME1	Q06323	249 aa		32.22	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.22	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.22	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
KIFC3-227	ENST00000566914	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.18	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.17	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.17	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.16	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.16	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.15	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	ATRN	O75882	1429 aa		32.14	■■■□□ 2.74
KIFC3-227	ENST00000566914	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.13	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.13	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.12	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.11	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	ATP7B	P35670	1465 aa		32.1	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.09	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.09	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.09	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.08	■■■□□ 2.73
KIFC3-227	ENST00000566914	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
KIFC3-227	ENST00000566914	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.07	■■■□□ 2.72
KIFC3-227	ENST00000566914	SLIT2	O94813	1529 aa		32.05	■■■□□ 2.72
KIFC3-227	ENST00000566914	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.05	■■■□□ 2.72
KIFC3-227	ENST00000566914	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.04	■■■□□ 2.72
KIFC3-227	ENST00000566914	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
KIFC3-227	ENST00000566914	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.03	■■■□□ 2.72
KIFC3-227	ENST00000566914	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.01	■■■□□ 2.71
KIFC3-227	ENST00000566914	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
KIFC3-227	ENST00000566914	GLI3	P10071	1580 aa		31.98	■■■□□ 2.71
KIFC3-227	ENST00000566914	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		31.98	■■■□□ 2.71
KIFC3-227	ENST00000566914	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.98	■■■□□ 2.71
KIFC3-227	ENST00000566914	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
KIFC3-227	ENST00000566914	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.97	■■■□□ 2.71

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