RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566914.1

KIFC3-227, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 3

Gene KIFC3, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-227ENST00000566914 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.07■■■■■ 6.41
KIFC3-227ENST00000566914 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.27■■■■■ 5.48
KIFC3-227ENST00000566914 ABCC9O60706 1549 aa48.93■■■■■ 5.42
KIFC3-227ENST00000566914 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.69■■■■■ 5.07
KIFC3-227ENST00000566914 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.42■■■■■ 5.02
KIFC3-227ENST00000566914 NACADO15069 1562 aa46.42■■■■■ 5.02
KIFC3-227ENST00000566914 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.81■■■■■ 4.92
KIFC3-227ENST00000566914 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.78■■■■■ 4.92
KIFC3-227ENST00000566914 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
KIFC3-227ENST00000566914 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.61■■■■■ 4.89
KIFC3-227ENST00000566914 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.46■■■■■ 4.87
KIFC3-227ENST00000566914 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.42■■■■■ 4.86
KIFC3-227ENST00000566914 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.33■■■■■ 4.85
KIFC3-227ENST00000566914 SCRIBQ14160 1630 aa45.04■■■■■ 4.8
KIFC3-227ENST00000566914 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.61■■■■■ 4.73
KIFC3-227ENST00000566914 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.21■■■■■ 4.67
KIFC3-227ENST00000566914 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
KIFC3-227ENST00000566914 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.98■■■■■ 4.63
KIFC3-227ENST00000566914 SMARCA4P51532 1647 aa42.93■■■■■ 4.46
KIFC3-227ENST00000566914 NCAPD3P42695 1498 aa42.81■■■■■ 4.44
KIFC3-227ENST00000566914 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.8■■■■■ 4.44
KIFC3-227ENST00000566914 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
KIFC3-227ENST00000566914 SMARCA2P51531 1590 aa42.71■■■■■ 4.43
KIFC3-227ENST00000566914 HMGXB3Q12766 1538 aa42.59■■■■■ 4.41
KIFC3-227ENST00000566914 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.49■■■■■ 4.39
KIFC3-227ENST00000566914 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
KIFC3-227ENST00000566914 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.41■■■■■ 4.38
KIFC3-227ENST00000566914 ERCC6Q03468 1493 aa42.21■■■■■ 4.35
KIFC3-227ENST00000566914 NESP48681 1621 aa42.17■■■■■ 4.34
KIFC3-227ENST00000566914 WIZO95785 1651 aa42.08■■■■■ 4.33
KIFC3-227ENST00000566914 CUX2O14529 1486 aa41.88■■■■■ 4.29
KIFC3-227ENST00000566914 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.84■■■■■ 4.29
KIFC3-227ENST00000566914 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
KIFC3-227ENST00000566914 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.7■■■■■ 4.27
KIFC3-227ENST00000566914 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
KIFC3-227ENST00000566914 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.55■■■■■ 4.24
KIFC3-227ENST00000566914 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.55■■■■■ 4.24
KIFC3-227ENST00000566914 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
KIFC3-227ENST00000566914 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.35■■■■■ 4.21
KIFC3-227ENST00000566914 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.23■■■■■ 4.19
KIFC3-227ENST00000566914 CFTRP13569 1480 aa41.17■■■■■ 4.18
KIFC3-227ENST00000566914 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.16■■■■■ 4.18
KIFC3-227ENST00000566914 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.15■■■■■ 4.18
KIFC3-227ENST00000566914 WDR62O43379 1518 aa41.11■■■■■ 4.17
KIFC3-227ENST00000566914 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.01■■■■■ 4.16
KIFC3-227ENST00000566914 PRDM2Q13029 1718 aa40.96■■■■■ 4.15
KIFC3-227ENST00000566914 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
KIFC3-227ENST00000566914 TOPBP1Q92547 1522 aa40.42■■■■■ 4.06
KIFC3-227ENST00000566914 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.32■■■■■ 4.05
KIFC3-227ENST00000566914 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
KIFC3-227ENST00000566914 IFT140Q96RY7 1462 aa40.28■■■■■ 4.04
KIFC3-227ENST00000566914 ABCC8Q09428 1581 aa40.27■■■■■ 4.04
KIFC3-227ENST00000566914 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
KIFC3-227ENST00000566914 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
KIFC3-227ENST00000566914 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
KIFC3-227ENST00000566914 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
KIFC3-227ENST00000566914 OSCARQ8IYS5 282 aa40.03■■■■■ 4
KIFC3-227ENST00000566914 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.98
KIFC3-227ENST00000566914 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.93■■■■□ 3.98
KIFC3-227ENST00000566914 CUX1P39880 1505 aa39.91■■■■□ 3.98
KIFC3-227ENST00000566914 TRIM41Q8WV44 630 aa39.9■■■■□ 3.98
KIFC3-227ENST00000566914 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.88■■■■□ 3.97
KIFC3-227ENST00000566914 SOGA1O94964 1423 aa39.83■■■■□ 3.97
KIFC3-227ENST00000566914 CHD1O14646 1710 aa39.77■■■■□ 3.96
KIFC3-227ENST00000566914 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
KIFC3-227ENST00000566914 FBLN2P98095 1184 aa39.62■■■■□ 3.93
KIFC3-227ENST00000566914 WDR97A6NE52 1622 aa39.61■■■■□ 3.93
KIFC3-227ENST00000566914 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.6■■■■□ 3.93
KIFC3-227ENST00000566914 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.6■■■■□ 3.93
KIFC3-227ENST00000566914 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.6■■■■□ 3.93
KIFC3-227ENST00000566914 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.55■■■■□ 3.92
KIFC3-227ENST00000566914 ARHGEF11O15085 1522 aa39.47■■■■□ 3.91
KIFC3-227ENST00000566914 PBRM1Q86U86 1689 aa39.46■■■■□ 3.91
KIFC3-227ENST00000566914 GRIN2BQ13224 1484 aa39.44■■■■□ 3.9
KIFC3-227ENST00000566914 SYNJ1O43426 1573 aa39.39■■■■□ 3.9
KIFC3-227ENST00000566914 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.39■■■■□ 3.9
KIFC3-227ENST00000566914 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.38■■■■□ 3.9
KIFC3-227ENST00000566914 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.9
KIFC3-227ENST00000566914 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.38■■■■□ 3.89
KIFC3-227ENST00000566914 TOP2BQ02880 1626 aa39.36■■■■□ 3.89
KIFC3-227ENST00000566914 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.36■■■■□ 3.89
KIFC3-227ENST00000566914 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.35■■■■□ 3.89
KIFC3-227ENST00000566914 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
KIFC3-227ENST00000566914 SYNJ2O15056 1496 aa39.26■■■■□ 3.88
KIFC3-227ENST00000566914 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.19■■■■□ 3.86
KIFC3-227ENST00000566914 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.14■■■■□ 3.86
KIFC3-227ENST00000566914 ARAP1Q96P48 1450 aa39.11■■■■□ 3.85
KIFC3-227ENST00000566914 ADAMTS12P58397 1594 aa39.04■■■■□ 3.84
KIFC3-227ENST00000566914 GRIN2AQ12879 1464 aa38.95■■■■□ 3.83
KIFC3-227ENST00000566914 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.89■■■■□ 3.82
KIFC3-227ENST00000566914 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.86■■■■□ 3.81
KIFC3-227ENST00000566914 CEP170Q5SW79 1584 aa38.85■■■■□ 3.81
KIFC3-227ENST00000566914 NUP160Q12769 1436 aa38.76■■■■□ 3.8
KIFC3-227ENST00000566914 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.7■■■■□ 3.79
KIFC3-227ENST00000566914 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
KIFC3-227ENST00000566914 SHROOM2Q13796 1616 aa38.6■■■■□ 3.77
KIFC3-227ENST00000566914 KIF27Q86VH2 1401 aa38.56■■■■□ 3.76
KIFC3-227ENST00000566914 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.48■■■■□ 3.75
KIFC3-227ENST00000566914 IGF1RP08069 1367 aa38.47■■■■□ 3.75
KIFC3-227ENST00000566914 CUL7Q14999 1698 aa38.47■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 169.4 ms