RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 PNPLA6Q8IY17 1366 aa37.29■■■■□ 3.56
PPP4C-208ENST00000564966 NUTM2FA1L443 756 aa37.28■■■■□ 3.56
PPP4C-208ENST00000564966 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa37.28■■■■□ 3.56
PPP4C-208ENST00000564966 ABCC11Q96J66 1382 aa37.27■■■■□ 3.56
PPP4C-208ENST00000564966 TECPR2O15040 1411 aa37.27■■■■□ 3.56
PPP4C-208ENST00000564966 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
PPP4C-208ENST00000564966 C8orf37Q96NL8 207 aa37.25■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.24■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 AFF2P51816 1311 aa37.24■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa37.24■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 KNDC1Q76NI1 1749 aa37.23■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 MYOM2P54296 1465 aa37.21■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 ADAMTS2O95450 1211 aa37.21■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
PPP4C-208ENST00000564966 LAMC1P11047 1609 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-208ENST00000564966 NPHP3Q7Z494 1330 aa37.18■■■■□ 3.54
PPP4C-208ENST00000564966 RXRBP28702 533 aa37.18■■■■□ 3.54
PPP4C-208ENST00000564966 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.16■■■■□ 3.54
PPP4C-208ENST00000564966 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
PPP4C-208ENST00000564966 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.16■■■■□ 3.54
PPP4C-208ENST00000564966 FOXO3O43524 673 aa37.15■■■■□ 3.54
PPP4C-208ENST00000564966 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
PPP4C-208ENST00000564966 NGLY1Q96IV0 654 aa37.14■■■■□ 3.54
PPP4C-208ENST00000564966 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.1■■■■□ 3.53
PPP4C-208ENST00000564966 SIRT1Q96EB6 747 aa37.1■■■■□ 3.53
PPP4C-208ENST00000564966 POGKQ9P215 609 aa37.1■■■■□ 3.53
PPP4C-208ENST00000564966 PRAM1Q96QH2 718 aa37.09■■■■□ 3.53
PPP4C-208ENST00000564966 HRCP23327 699 aa37.08■■■■□ 3.53
PPP4C-208ENST00000564966 FMN2Q9NZ56 1722 aa37.07■■■■□ 3.53
PPP4C-208ENST00000564966 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
PPP4C-208ENST00000564966 PXDNQ92626 1479 aa37.04■■■■□ 3.52
PPP4C-208ENST00000564966 TRAK1Q9UPV9 953 aa37.01■■■■□ 3.52
PPP4C-208ENST00000564966 KIF1AQ12756 1690 aa36.99■■■■□ 3.51
PPP4C-208ENST00000564966 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
PPP4C-208ENST00000564966 USP21Q9UK80 565 aa36.98■■■■□ 3.51
PPP4C-208ENST00000564966 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
PPP4C-208ENST00000564966 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.96■■■■□ 3.51
PPP4C-208ENST00000564966 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.95■■■■□ 3.51
PPP4C-208ENST00000564966 DLC1Q96QB1 1528 aa36.95■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 ADGRB1O14514 1584 aa36.92■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 STAC3Q96MF2 364 aa36.92■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 PLEKHG5O94827 1062 aa36.9■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 PSME1Q06323 249 aa36.89■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.88■■■■□ 3.49
PPP4C-208ENST00000564966 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.88■■■■□ 3.49
PPP4C-208ENST00000564966 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.87■■■■□ 3.49
PPP4C-208ENST00000564966 RGS12O14924 1447 aa36.86■■■■□ 3.49
PPP4C-208ENST00000564966 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
PPP4C-208ENST00000564966 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.86■■■■□ 3.49
PPP4C-208ENST00000564966 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.81■■■■□ 3.48
PPP4C-208ENST00000564966 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
PPP4C-208ENST00000564966 ADGRB2O60241 1585 aa36.8■■■■□ 3.48
PPP4C-208ENST00000564966 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.8■■■■□ 3.48
PPP4C-208ENST00000564966 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
PPP4C-208ENST00000564966 USP32Q8NFA0 1604 aa36.76■■■■□ 3.48
PPP4C-208ENST00000564966 ATRNO75882 1429 aa36.76■■■■□ 3.47
PPP4C-208ENST00000564966 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.75■■■■□ 3.47
PPP4C-208ENST00000564966 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
PPP4C-208ENST00000564966 SBNO1A3KN83 1393 aa36.73■■■■□ 3.47
PPP4C-208ENST00000564966 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.72■■■■□ 3.47
PPP4C-208ENST00000564966 ARHGEF10O15013 1369 aa36.71■■■■□ 3.47
PPP4C-208ENST00000564966 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.71■■■■□ 3.47
PPP4C-208ENST00000564966 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.7■■■■□ 3.47
PPP4C-208ENST00000564966 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
PPP4C-208ENST00000564966 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.68■■■■□ 3.46
PPP4C-208ENST00000564966 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
PPP4C-208ENST00000564966 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.66■■■■□ 3.46
PPP4C-208ENST00000564966 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
PPP4C-208ENST00000564966 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP4C-208ENST00000564966 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
PPP4C-208ENST00000564966 SLIT2O94813 1529 aa36.6■■■■□ 3.45
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
PPP4C-208ENST00000564966 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP4C-208ENST00000564966 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP4C-208ENST00000564966 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PPP4C-208ENST00000564966 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
PPP4C-208ENST00000564966 CDK19Q9BWU1 502 aa36.57■■■■□ 3.44
PPP4C-208ENST00000564966 ABCA3Q99758 1704 aa36.56■■■■□ 3.44
PPP4C-208ENST00000564966 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
PPP4C-208ENST00000564966 ITSN1Q15811 1721 aa36.55■■■■□ 3.44
PPP4C-208ENST00000564966 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.54■■■■□ 3.44
PPP4C-208ENST00000564966 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.52■■■■□ 3.44
PPP4C-208ENST00000564966 ATP7BP35670 1465 aa36.52■■■■□ 3.44
PPP4C-208ENST00000564966 NEUROD1Q13562 356 aa36.52■■■■□ 3.44
PPP4C-208ENST00000564966 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.5■■■■□ 3.43
PPP4C-208ENST00000564966 ALS2Q96Q42 1657 aa36.49■■■■□ 3.43
PPP4C-208ENST00000564966 FAM83GA6ND36 823 aa36.49■■■■□ 3.43
PPP4C-208ENST00000564966 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.49■■■■□ 3.43
PPP4C-208ENST00000564966 GLI3P10071 1580 aa36.49■■■■□ 3.43
PPP4C-208ENST00000564966 VPS72Q15906 364 aa36.47■■■■□ 3.43
PPP4C-208ENST00000564966 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.46■■■■□ 3.43
PPP4C-208ENST00000564966 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
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