RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557415.5

PRMT5-225, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 2

Gene PRMT5, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-225	ENST00000557415	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
PRMT5-225	ENST00000557415	ABCC11	Q96J66	1382 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PRMT5-225	ENST00000557415	AFF2	P51816	1311 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PRMT5-225	ENST00000557415	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
PRMT5-225	ENST00000557415	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		33.8	■■■■□ 3
PRMT5-225	ENST00000557415	RXRB	P28702	533 aa		33.79	■■■■□ 3
PRMT5-225	ENST00000557415	STK26	Q9P289	416 aa		33.78	■■■■□ 3
PRMT5-225	ENST00000557415	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
PRMT5-225	ENST00000557415	MYOM2	P54296	1465 aa		33.77	■■■■□ 3
PRMT5-225	ENST00000557415	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.77	■■■■□ 3
PRMT5-225	ENST00000557415	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		33.77	■■■■□ 3
PRMT5-225	ENST00000557415	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
PRMT5-225	ENST00000557415	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PRMT5-225	ENST00000557415	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PRMT5-225	ENST00000557415	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PRMT5-225	ENST00000557415	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
PRMT5-225	ENST00000557415	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PRMT5-225	ENST00000557415	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PRMT5-225	ENST00000557415	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PRMT5-225	ENST00000557415	PXDN	Q92626	1479 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PRMT5-225	ENST00000557415	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PRMT5-225	ENST00000557415	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PRMT5-225	ENST00000557415	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PRMT5-225	ENST00000557415	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
PRMT5-225	ENST00000557415	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PRMT5-225	ENST00000557415	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.65	■■■□□ 2.98
PRMT5-225	ENST00000557415	KIF1A	Q12756	1690 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PRMT5-225	ENST00000557415	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
PRMT5-225	ENST00000557415	FOXO3	O43524	673 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PRMT5-225	ENST00000557415	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PRMT5-225	ENST00000557415	RGS12	O14924	1447 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PRMT5-225	ENST00000557415	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PRMT5-225	ENST00000557415	NUTM2F	A1L443	756 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PRMT5-225	ENST00000557415	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PRMT5-225	ENST00000557415	DLC1	Q96QB1	1528 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PRMT5-225	ENST00000557415	HRC	P23327	699 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PRMT5-225	ENST00000557415	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
PRMT5-225	ENST00000557415	USP21	Q9UK80	565 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PRMT5-225	ENST00000557415	ADGRB1	O14514	1584 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PRMT5-225	ENST00000557415	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
PRMT5-225	ENST00000557415	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
PRMT5-225	ENST00000557415	ATRN	O75882	1429 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PRMT5-225	ENST00000557415	PRAM1	Q96QH2	718 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PRMT5-225	ENST00000557415	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PRMT5-225	ENST00000557415	ADGRB2	O60241	1585 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PRMT5-225	ENST00000557415	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PRMT5-225	ENST00000557415	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PRMT5-225	ENST00000557415	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PRMT5-225	ENST00000557415	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PRMT5-225	ENST00000557415	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		33.45	■■■□□ 2.94
PRMT5-225	ENST00000557415	USP32	Q8NFA0	1604 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PRMT5-225	ENST00000557415	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PRMT5-225	ENST00000557415	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	33.43	■■■□□ 2.94
PRMT5-225	ENST00000557415	POGK	Q9P215	609 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PRMT5-225	ENST00000557415	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PRMT5-225	ENST00000557415	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PRMT5-225	ENST00000557415	SBNO1	A3KN83	1393 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PRMT5-225	ENST00000557415	PSME1	Q06323	249 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PRMT5-225	ENST00000557415	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PRMT5-225	ENST00000557415	SLIT2	O94813	1529 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PRMT5-225	ENST00000557415	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PRMT5-225	ENST00000557415	EP400	Q96L91	3159 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PRMT5-225	ENST00000557415	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PRMT5-225	ENST00000557415	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PRMT5-225	ENST00000557415	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PRMT5-225	ENST00000557415	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	GLI3	P10071	1580 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PRMT5-225	ENST00000557415	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
PRMT5-225	ENST00000557415	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PRMT5-225	ENST00000557415	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PRMT5-225	ENST00000557415	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PRMT5-225	ENST00000557415	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PRMT5-225	ENST00000557415	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PRMT5-225	ENST00000557415	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PRMT5-225	ENST00000557415	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PRMT5-225	ENST00000557415	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PRMT5-225	ENST00000557415	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PRMT5-225	ENST00000557415	VPS72	Q15906	364 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PRMT5-225	ENST00000557415	ATP7B	P35670	1465 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PRMT5-225	ENST00000557415	CCDC125	Q86Z20	511 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PRMT5-225	ENST00000557415	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.14	■■■□□ 2.89
PRMT5-225	ENST00000557415	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PRMT5-225	ENST00000557415	NRAP	Q86VF7	1730 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PRMT5-225	ENST00000557415	FAM83G	A6ND36	823 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PRMT5-225	ENST00000557415	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PRMT5-225	ENST00000557415	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
PRMT5-225	ENST00000557415	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PRMT5-225	ENST00000557415	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PRMT5-225	ENST00000557415	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PRMT5-225	ENST00000557415	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.08	■■■□□ 2.89

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