RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 GLI3P10071 1580 aa21.13■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 FOXO3O43524 673 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 ITGAEP38570 1179 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 PXDNQ92626 1479 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-231ENST00000552222 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.06■□□□□ 0.96
CS-231ENST00000552222 CLTCL1P53675 1640 aa21.05■□□□□ 0.96
CS-231ENST00000552222 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CS-231ENST00000552222 HRCP23327 699 aa21.04■□□□□ 0.96
CS-231ENST00000552222 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.04■□□□□ 0.96
CS-231ENST00000552222 LRP5O75197 1615 aa21.04■□□□□ 0.96
CS-231ENST00000552222 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.03■□□□□ 0.96
CS-231ENST00000552222 SLIT2O94813 1529 aa21.02■□□□□ 0.96
CS-231ENST00000552222 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.02■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 FAM182BQ5T319 152 aa21■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.99■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 ROCK1Q13464 1354 aa20.97■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.96■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 STK26Q9P289 416 aa20.96■□□□□ 0.95
CS-231ENST00000552222 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.95■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 NAIPQ13075 1403 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 A0A0G2JS52 829 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 MYT1Q01538 1121 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 HFM1A2PYH4 1435 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 VPS72Q15906 364 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 USP32Q8NFA0 1604 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.89■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 BAG6P46379 1132 aa20.88■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 FAM83GA6ND36 823 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 KIF1BO60333 1816 aa20.86■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.86■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.86■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 YY1P25490 414 aa20.83■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 PPLO60437 1756 aa20.79■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.78■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 BTG4Q9NY30 223 aa20.78■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.78■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 RGL3Q3MIN7 710 aa20.77■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.77■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.77■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 ABCA3Q99758 1704 aa20.76■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.76■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.75■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 TRIM37O94972 964 aa20.74■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.74■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 NRAPQ86VF7 1730 aa20.73■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.73■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 TECPR2O15040 1411 aa20.71■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 KIF1AQ12756 1690 aa20.71■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 PSME1Q06323 249 aa20.71■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.7■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 ABCC11Q96J66 1382 aa20.69■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.68■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.68■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 SBNO1A3KN83 1393 aa20.67■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 APBA3O96018 575 aa20.66■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.66■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 IFT172Q9UG01 1749 aa20.65■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 DISP2A7MBM2 1401 aa20.65■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.64■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 ARHGEF10O15013 1369 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 CHRNA2Q15822 529 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 PRAM1Q96QH2 718 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 USP35Q9P2H5 1018 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 STRN4Q9NRL3 753 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 PIK3C2GO75747 1445 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms