RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.86■■■■□ 3.49
MACROD1-208ENST00000545464 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
MACROD1-208ENST00000545464 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
MACROD1-208ENST00000545464 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.85■■■■□ 3.49
MACROD1-208ENST00000545464 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.85■■■■□ 3.49
MACROD1-208ENST00000545464 NUTM2FA1L443 756 aa36.83■■■■□ 3.49
MACROD1-208ENST00000545464 PPLO60437 1756 aa36.83■■■■□ 3.49
MACROD1-208ENST00000545464 FOXO3O43524 673 aa36.82■■■■□ 3.48
MACROD1-208ENST00000545464 RGL3Q3MIN7 710 aa36.82■■■■□ 3.48
MACROD1-208ENST00000545464 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.8■■■■□ 3.48
MACROD1-208ENST00000545464 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.78■■■■□ 3.48
MACROD1-208ENST00000545464 ATRNO75882 1429 aa36.76■■■■□ 3.48
MACROD1-208ENST00000545464 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
MACROD1-208ENST00000545464 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.74■■■■□ 3.47
MACROD1-208ENST00000545464 MYOM2P54296 1465 aa36.74■■■■□ 3.47
MACROD1-208ENST00000545464 PXDNQ92626 1479 aa36.73■■■■□ 3.47
MACROD1-208ENST00000545464 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.72■■■■□ 3.47
MACROD1-208ENST00000545464 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.72■■■■□ 3.47
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.71■■■■□ 3.47
MACROD1-208ENST00000545464 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
MACROD1-208ENST00000545464 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.69■■■■□ 3.46
MACROD1-208ENST00000545464 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
MACROD1-208ENST00000545464 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.65■■■■□ 3.46
MACROD1-208ENST00000545464 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.65■■■■□ 3.46
MACROD1-208ENST00000545464 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.64■■■■□ 3.46
MACROD1-208ENST00000545464 EP400Q96L91 3159 aa36.62■■■■□ 3.45
MACROD1-208ENST00000545464 TECPR2O15040 1411 aa36.61■■■■□ 3.45
MACROD1-208ENST00000545464 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.61■■■■□ 3.45
MACROD1-208ENST00000545464 ABCC11Q96J66 1382 aa36.61■■■■□ 3.45
MACROD1-208ENST00000545464 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.59■■■■□ 3.45
MACROD1-208ENST00000545464 PLEKHG5O94827 1062 aa36.58■■■■□ 3.45
MACROD1-208ENST00000545464 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
MACROD1-208ENST00000545464 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.57■■■■□ 3.44
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC125Q86Z20 511 aa36.57■■■■□ 3.44
MACROD1-208ENST00000545464 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.57■■■■□ 3.44
MACROD1-208ENST00000545464 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
MACROD1-208ENST00000545464 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.56■■■■□ 3.44
MACROD1-208ENST00000545464 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
MACROD1-208ENST00000545464 PIK3C2GO75747 1445 aa36.52■■■■□ 3.44
MACROD1-208ENST00000545464 IFT172Q9UG01 1749 aa36.51■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.49■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.49■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.48■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.48■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.47■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.47■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.47■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 KIF1AQ12756 1690 aa36.46■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 SLIT2O94813 1529 aa36.46■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 PSME1Q06323 249 aa36.46■■■■□ 3.43
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.43■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 SIRT1Q96EB6 747 aa36.43■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 GLI3P10071 1580 aa36.43■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 USP32Q8NFA0 1604 aa36.4■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.4■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.39■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 PRAM1Q96QH2 718 aa36.39■■■■□ 3.42
MACROD1-208ENST00000545464 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
MACROD1-208ENST00000545464 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
MACROD1-208ENST00000545464 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
MACROD1-208ENST00000545464 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.36■■■■□ 3.41
MACROD1-208ENST00000545464 VPS72Q15906 364 aa36.35■■■■□ 3.41
MACROD1-208ENST00000545464 POGKQ9P215 609 aa36.35■■■■□ 3.41
MACROD1-208ENST00000545464 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.34■■■■□ 3.41
MACROD1-208ENST00000545464 SBNO1A3KN83 1393 aa36.31■■■■□ 3.4
MACROD1-208ENST00000545464 A0A0G2JS52 829 aa36.31■■■■□ 3.4
MACROD1-208ENST00000545464 MYT1Q01538 1121 aa36.31■■■■□ 3.4
MACROD1-208ENST00000545464 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.3■■■■□ 3.4
MACROD1-208ENST00000545464 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.29■■■■□ 3.4
MACROD1-208ENST00000545464 ARHGEF10O15013 1369 aa36.29■■■■□ 3.4
MACROD1-208ENST00000545464 FAM83GA6ND36 823 aa36.27■■■■□ 3.4
MACROD1-208ENST00000545464 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.27■■■■□ 3.4
MACROD1-208ENST00000545464 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.24■■■■□ 3.39
MACROD1-208ENST00000545464 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
MACROD1-208ENST00000545464 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
MACROD1-208ENST00000545464 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.22■■■■□ 3.39
MACROD1-208ENST00000545464 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
MACROD1-208ENST00000545464 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.2■■■■□ 3.38
MACROD1-208ENST00000545464 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.18■■■■□ 3.38
MACROD1-208ENST00000545464 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
MACROD1-208ENST00000545464 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
MACROD1-208ENST00000545464 BTG4Q9NY30 223 aa36.18■■■■□ 3.38
MACROD1-208ENST00000545464 ABCA3Q99758 1704 aa36.17■■■■□ 3.38
MACROD1-208ENST00000545464 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.16■■■■□ 3.38
MACROD1-208ENST00000545464 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.15■■■■□ 3.38
MACROD1-208ENST00000545464 DLC1Q96QB1 1528 aa36.15■■■■□ 3.38
MACROD1-208ENST00000545464 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
MACROD1-208ENST00000545464 BAG6P46379 1132 aa36.1■■■■□ 3.37
MACROD1-208ENST00000545464 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
MACROD1-208ENST00000545464 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.08■■■■□ 3.37
MACROD1-208ENST00000545464 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
MACROD1-208ENST00000545464 ADGRB2O60241 1585 aa36.07■■■■□ 3.37
MACROD1-208ENST00000545464 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.07■■■■□ 3.36
MACROD1-208ENST00000545464 ADGRB1O14514 1584 aa36.06■■■■□ 3.36
MACROD1-208ENST00000545464 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
MACROD1-208ENST00000545464 FAM182BQ5T319 152 aa36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms