RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 WDR63Q8IWG1 891 aa13.47□□□□□ -0.25
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CS-202ENST00000542324 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 CCDC27Q2M243 656 aa13.46□□□□□ -0.26
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CS-202ENST00000542324 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.4□□□□□ -0.26
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CS-202ENST00000542324 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-202ENST00000542324 MCM4P33991 863 aa13.39□□□□□ -0.27
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CS-202ENST00000542324 MVPQ14764 893 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
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CS-202ENST00000542324 MORC1Q86VD1 984 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-202ENST00000542324 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-202ENST00000542324 CFAP53Q96M91 514 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-202ENST00000542324 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.37□□□□□ -0.27
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CS-202ENST00000542324 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.36□□□□□ -0.27
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CS-202ENST00000542324 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-202ENST00000542324 OSCARQ8IYS5 282 aa13.36□□□□□ -0.27
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CS-202ENST00000542324 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
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CS-202ENST00000542324 ADGRB1O14514 1584 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-202ENST00000542324 PTMSP20962 102 aa13.33□□□□□ -0.27
CS-202ENST00000542324 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 ABCC11Q96J66 1382 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 HSCBQ8IWL3 235 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 SNX21Q969T3 373 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 DDX19BQ9UMR2 479 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 REREQ9P2R6 1566 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 TRAK2O60296 914 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 SMC5Q8IY18 1101 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 IL16Q14005 1332 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
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CS-202ENST00000542324 NEUROD2Q15784 382 aa13.27□□□□□ -0.28
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CS-202ENST00000542324 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.27□□□□□ -0.28
CS-202ENST00000542324 KIF16BQ96L93 1317 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 KIF3BO15066 747 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.27□□□□□ -0.29
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