RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYT1Q01538 1121 aa15.98■□□□□ 0.15
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXO3O43524 673 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.96■□□□□ 0.15
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APLP2Q06481 763 aa15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP155O75694 1391 aa15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.8■□□□□ 0.12
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM83GA6ND36 823 aa15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM37O94972 964 aa15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPON1Q9HCB6 807 aa15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAIPQ13075 1403 aa15.73■□□□□ 0.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DISP2A7MBM2 1401 aa15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1QTNF8P60827 252 aa15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.71■□□□□ 0.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP350Q5VT06 3117 aa15.7■□□□□ 0.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITGAEP38570 1179 aa15.7■□□□□ 0.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.7■□□□□ 0.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15.66■□□□□ 0.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF10O15013 1369 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP35Q9P2H5 1018 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRAPQ86VF7 1730 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF1AQ12756 1690 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF1BO60333 1816 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROCK1Q13464 1354 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STRN4Q9NRL3 753 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SBNO1A3KN83 1393 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCA3Q99758 1704 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDE3BQ13370 1112 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB7AO95365 584 aa15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.58■□□□□ 0.08
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