RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PUF60-218ENST00000531995 C8orf37Q96NL8 207 aa27.27■■□□□ 1.96
PUF60-218ENST00000531995 ORAI2Q96SN7 254 aa27.27■■□□□ 1.96
PUF60-218ENST00000531995 RGL3Q3MIN7 710 aa27.26■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 RXRBP28702 533 aa27.23■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 PIK3C2GO75747 1445 aa27.23■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 ADAMTS2O95450 1211 aa27.21■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 RGS12O14924 1447 aa27.21■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 TECPR2O15040 1411 aa27.21■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.21■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
PUF60-218ENST00000531995 STK26Q9P289 416 aa27.2■■□□□ 1.94
PUF60-218ENST00000531995 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.18■■□□□ 1.94
PUF60-218ENST00000531995 PXDNQ92626 1479 aa27.18■■□□□ 1.94
PUF60-218ENST00000531995 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
PUF60-218ENST00000531995 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.15■■□□□ 1.94
PUF60-218ENST00000531995 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
PUF60-218ENST00000531995 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.14■■□□□ 1.94
PUF60-218ENST00000531995 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.14■■□□□ 1.94
PUF60-218ENST00000531995 NUTM2FA1L443 756 aa27.13■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 KIF1AQ12756 1690 aa27.13■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 MYOM2P54296 1465 aa27.13■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 NGLY1Q96IV0 654 aa27.11■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.11■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 ABCC11Q96J66 1382 aa27.09■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.09■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.09■■□□□ 1.93
PUF60-218ENST00000531995 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PUF60-218ENST00000531995 FOXO3O43524 673 aa27.06■■□□□ 1.92
PUF60-218ENST00000531995 USP21Q9UK80 565 aa27.05■■□□□ 1.92
PUF60-218ENST00000531995 ATRNO75882 1429 aa27.01■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 EP400Q96L91 3159 aa27.01■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 USP32Q8NFA0 1604 aa27■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 ABCA3Q99758 1704 aa26.99■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.99■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 NEUROD1Q13562 356 aa26.96■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 ADGRB1O14514 1584 aa26.96■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 ADGRB2O60241 1585 aa26.96■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 DLC1Q96QB1 1528 aa26.95■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.95■■□□□ 1.91
PUF60-218ENST00000531995 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.93■■□□□ 1.9
PUF60-218ENST00000531995 PRAM1Q96QH2 718 aa26.93■■□□□ 1.9
PUF60-218ENST00000531995 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.93■■□□□ 1.9
PUF60-218ENST00000531995 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.92■■□□□ 1.9
PUF60-218ENST00000531995 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.92■■□□□ 1.9
PUF60-218ENST00000531995 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.91■■□□□ 1.9
PUF60-218ENST00000531995 GLI3P10071 1580 aa26.89■■□□□ 1.9
PUF60-218ENST00000531995 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.89■■□□□ 1.9
PUF60-218ENST00000531995 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.89■■□□□ 1.9
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHG5O94827 1062 aa26.88■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.88■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.88■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 SLIT2O94813 1529 aa26.87■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 SIRT1Q96EB6 747 aa26.87■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 STAC3Q96MF2 364 aa26.85■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 POGKQ9P215 609 aa26.85■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.85■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.84■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.84■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.83■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.83■■□□□ 1.89
PUF60-218ENST00000531995 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.81■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.81■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.81■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 ALS2Q96Q42 1657 aa26.8■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.8■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.8■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 SBNO1A3KN83 1393 aa26.8■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.79■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 ITSN1Q15811 1721 aa26.78■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 NRAPQ86VF7 1730 aa26.78■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF10O15013 1369 aa26.77■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 PSME1Q06323 249 aa26.77■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.77■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.76■■□□□ 1.88
PUF60-218ENST00000531995 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.74■■□□□ 1.87
PUF60-218ENST00000531995 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PUF60-218ENST00000531995 TONSLQ96HA7 1378 aa26.71■■□□□ 1.87
PUF60-218ENST00000531995 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.7■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 ATP7BP35670 1465 aa26.69■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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