RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 USP21Q9UK80 565 aa24.62■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 METP08581 1390 aa24.62■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 LRP5O75197 1615 aa24.6■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 CLTCL1P53675 1640 aa24.6■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.59■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 PTCH1Q13635 1447 aa24.58■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
PACS1-208ENST00000529677 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.58■■□□□ 1.52
PACS1-208ENST00000529677 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PACS1-208ENST00000529677 MYOM2P54296 1465 aa24.55■■□□□ 1.52
PACS1-208ENST00000529677 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.54■■□□□ 1.52
PACS1-208ENST00000529677 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PACS1-208ENST00000529677 GLI3P10071 1580 aa24.51■■□□□ 1.51
PACS1-208ENST00000529677 CCDC125Q86Z20 511 aa24.51■■□□□ 1.51
PACS1-208ENST00000529677 ORAI2Q96SN7 254 aa24.5■■□□□ 1.51
PACS1-208ENST00000529677 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.49■■□□□ 1.51
PACS1-208ENST00000529677 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PACS1-208ENST00000529677 KIF1BO60333 1816 aa24.49■■□□□ 1.51
PACS1-208ENST00000529677 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PACS1-208ENST00000529677 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.46■■□□□ 1.51
PACS1-208ENST00000529677 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.46■■□□□ 1.51
PACS1-208ENST00000529677 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.45■■□□□ 1.5
PACS1-208ENST00000529677 PXDNQ92626 1479 aa24.43■■□□□ 1.5
PACS1-208ENST00000529677 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PACS1-208ENST00000529677 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.42■■□□□ 1.5
PACS1-208ENST00000529677 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.41■■□□□ 1.5
PACS1-208ENST00000529677 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.41■■□□□ 1.5
PACS1-208ENST00000529677 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.37■■□□□ 1.49
PACS1-208ENST00000529677 SLIT2O94813 1529 aa24.37■■□□□ 1.49
PACS1-208ENST00000529677 IFT172Q9UG01 1749 aa24.37■■□□□ 1.49
PACS1-208ENST00000529677 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.33■■□□□ 1.49
PACS1-208ENST00000529677 PPLO60437 1756 aa24.33■■□□□ 1.49
PACS1-208ENST00000529677 NEUROD1Q13562 356 aa24.32■■□□□ 1.48
PACS1-208ENST00000529677 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.29■■□□□ 1.48
PACS1-208ENST00000529677 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PACS1-208ENST00000529677 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.29■■□□□ 1.48
PACS1-208ENST00000529677 USP32Q8NFA0 1604 aa24.28■■□□□ 1.48
PACS1-208ENST00000529677 TONSLQ96HA7 1378 aa24.28■■□□□ 1.48
PACS1-208ENST00000529677 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PACS1-208ENST00000529677 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PACS1-208ENST00000529677 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.27■■□□□ 1.48
PACS1-208ENST00000529677 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.25■■□□□ 1.47
PACS1-208ENST00000529677 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.24■■□□□ 1.47
PACS1-208ENST00000529677 STAC3Q96MF2 364 aa24.24■■□□□ 1.47
PACS1-208ENST00000529677 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.24■■□□□ 1.47
PACS1-208ENST00000529677 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.24■■□□□ 1.47
PACS1-208ENST00000529677 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.23■■□□□ 1.47
PACS1-208ENST00000529677 RGL3Q3MIN7 710 aa24.22■■□□□ 1.47
PACS1-208ENST00000529677 FOXO3O43524 673 aa24.21■■□□□ 1.47
PACS1-208ENST00000529677 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.2■■□□□ 1.46
PACS1-208ENST00000529677 ABCA3Q99758 1704 aa24.19■■□□□ 1.46
PACS1-208ENST00000529677 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.18■■□□□ 1.46
PACS1-208ENST00000529677 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PACS1-208ENST00000529677 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.16■■□□□ 1.46
PACS1-208ENST00000529677 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.15■■□□□ 1.46
PACS1-208ENST00000529677 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PACS1-208ENST00000529677 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 PIK3C2GO75747 1445 aa24.14■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 VPS72Q15906 364 aa24.14■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 NRAPQ86VF7 1730 aa24.14■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.13■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.13■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.13■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.12■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.11■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 KIF1AQ12756 1690 aa24.1■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.1■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 NUTM2FA1L443 756 aa24.09■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 BAG6P46379 1132 aa24.08■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PACS1-208ENST00000529677 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.07■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.06■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 TECPR2O15040 1411 aa24.06■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.05■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 DISP2A7MBM2 1401 aa24.05■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.05■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.03■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.03■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.02■■□□□ 1.44
PACS1-208ENST00000529677 FAM182BQ5T319 152 aa24.01■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.01■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 ADGRB1O14514 1584 aa24■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 YY1P25490 414 aa23.99■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.99■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 FAM83GA6ND36 823 aa23.97■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 RREB1Q92766 1687 aa23.95■■□□□ 1.43
PACS1-208ENST00000529677 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.95■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHG5O94827 1062 aa23.94■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.93■■□□□ 1.42
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