RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-208ENST00000522399 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.55■■■■□ 3.44
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TTC13-208ENST00000522399 ABCC11Q96J66 1382 aa36.53■■■■□ 3.44
TTC13-208ENST00000522399 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.51■■■■□ 3.44
TTC13-208ENST00000522399 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
TTC13-208ENST00000522399 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.48■■■■□ 3.43
TTC13-208ENST00000522399 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
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TTC13-208ENST00000522399 AFF2P51816 1311 aa36.46■■■■□ 3.43
TTC13-208ENST00000522399 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.46■■■■□ 3.43
TTC13-208ENST00000522399 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.44■■■■□ 3.42
TTC13-208ENST00000522399 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
TTC13-208ENST00000522399 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.42■■■■□ 3.42
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TTC13-208ENST00000522399 C8orf37Q96NL8 207 aa36.42■■■■□ 3.42
TTC13-208ENST00000522399 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.4■■■■□ 3.42
TTC13-208ENST00000522399 SIRT1Q96EB6 747 aa36.38■■■■□ 3.41
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TTC13-208ENST00000522399 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.35■■■■□ 3.41
TTC13-208ENST00000522399 NUTM2FA1L443 756 aa36.35■■■■□ 3.41
TTC13-208ENST00000522399 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
TTC13-208ENST00000522399 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
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TTC13-208ENST00000522399 NGLY1Q96IV0 654 aa36.33■■■■□ 3.41
TTC13-208ENST00000522399 PXDNQ92626 1479 aa36.32■■■■□ 3.41
TTC13-208ENST00000522399 HRCP23327 699 aa36.32■■■■□ 3.4
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TTC13-208ENST00000522399 DLC1Q96QB1 1528 aa36.24■■■■□ 3.39
TTC13-208ENST00000522399 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.2■■■■□ 3.39
TTC13-208ENST00000522399 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.2■■■■□ 3.39
TTC13-208ENST00000522399 STAC3Q96MF2 364 aa36.2■■■■□ 3.39
TTC13-208ENST00000522399 POGKQ9P215 609 aa36.2■■■■□ 3.39
TTC13-208ENST00000522399 USP21Q9UK80 565 aa36.2■■■■□ 3.39
TTC13-208ENST00000522399 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.19■■■■□ 3.38
TTC13-208ENST00000522399 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
TTC13-208ENST00000522399 ADGRB1O14514 1584 aa36.19■■■■□ 3.38
TTC13-208ENST00000522399 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.38
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TTC13-208ENST00000522399 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
TTC13-208ENST00000522399 RGS12O14924 1447 aa36.17■■■■□ 3.38
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TTC13-208ENST00000522399 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.14■■■■□ 3.38
TTC13-208ENST00000522399 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.13■■■■□ 3.37
TTC13-208ENST00000522399 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.13■■■■□ 3.37
TTC13-208ENST00000522399 ADGRB2O60241 1585 aa36.11■■■■□ 3.37
TTC13-208ENST00000522399 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.11■■■■□ 3.37
TTC13-208ENST00000522399 PSME1Q06323 249 aa36.09■■■■□ 3.37
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TTC13-208ENST00000522399 ATRNO75882 1429 aa36.07■■■■□ 3.36
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TTC13-208ENST00000522399 ARHGEF10O15013 1369 aa35.97■■■■□ 3.35
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TTC13-208ENST00000522399 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.71■■■■□ 3.31
TTC13-208ENST00000522399 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
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TTC13-208ENST00000522399 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
TTC13-208ENST00000522399 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.66■■■■□ 3.3
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