RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM32Q13049 653 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HPS1Q92902 700 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GMPRP36959 345 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RDH13Q8NBN7 331 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GCGRP47871 477 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MMP16P51512 607 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 IRF7Q92985 503 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CFAP44Q96MT7 982 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HIC1Q14526 733 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SULF1Q8IWU6 871 aa7.55□□□□□ -1.2
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 WNT7BP56706 349 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERBB4Q15303 1308 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNPATO15228 680 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALDH1A1P00352 501 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VEGFBP49765 207 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 NLRP7Q8WX94 980 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHOX2BQ99453 314 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR37O15354 613 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCNMA1Q12791 1236 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VSIG8P0DPA2 414 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSK3AP49840 483 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFP42Q96MM3 310 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD46P15529 392 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 P3H3Q8IVL6 736 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KDM4AO75164 1064 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 JUNDP17535 347 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USP46P62068 366 aa7.39□□□□□ -1.23
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HLA-CQ95604 372 aa7.36□□□□□ -1.23
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH3BP2P78314 561 aa7.35□□□□□ -1.23
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCARF1Q14162 830 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MPNDQ8N594 471 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RASSF7Q02833 373 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RETREG3Q86VR2 466 aa7.32□□□□□ -1.24
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 TIMP2P16035 220 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NNTQ13423 1086 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GUCA2AQ02747 115 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.29□□□□□ -1.24
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTPRNQ16849 979 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BAP1Q92560 729 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAN1A2O60476 641 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF511Q8NB15 262 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRT76Q01546 638 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAP2K5Q13163 448 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC01559Q495D7 138 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHA1P01876 353 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCNH2Q12809 1159 aa7.23□□□□□ -1.25
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