RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 MYOM2P54296 1465 aa35.98■■■■□ 3.35
SIMC1-211ENST00000514128 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.96■■■■□ 3.35
SIMC1-211ENST00000514128 ABCC11Q96J66 1382 aa35.95■■■■□ 3.35
SIMC1-211ENST00000514128 ORAI2Q96SN7 254 aa35.95■■■■□ 3.35
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.94■■■■□ 3.34
SIMC1-211ENST00000514128 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
SIMC1-211ENST00000514128 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.92■■■■□ 3.34
SIMC1-211ENST00000514128 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.89■■■■□ 3.34
SIMC1-211ENST00000514128 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
SIMC1-211ENST00000514128 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.87■■■■□ 3.33
SIMC1-211ENST00000514128 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
SIMC1-211ENST00000514128 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.86■■■■□ 3.33
SIMC1-211ENST00000514128 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.86■■■■□ 3.33
SIMC1-211ENST00000514128 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.84■■■■□ 3.33
SIMC1-211ENST00000514128 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
SIMC1-211ENST00000514128 AFF2P51816 1311 aa35.83■■■■□ 3.33
SIMC1-211ENST00000514128 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.81■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 C8orf37Q96NL8 207 aa35.81■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 NUTM2FA1L443 756 aa35.79■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 KIF1AQ12756 1690 aa35.78■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 HRCP23327 699 aa35.78■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 SIRT1Q96EB6 747 aa35.77■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 PXDNQ92626 1479 aa35.76■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 ADAMTS2O95450 1211 aa35.76■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 RXRBP28702 533 aa35.76■■■■□ 3.32
SIMC1-211ENST00000514128 FOXO3O43524 673 aa35.73■■■■□ 3.31
SIMC1-211ENST00000514128 DLC1Q96QB1 1528 aa35.73■■■■□ 3.31
SIMC1-211ENST00000514128 NGLY1Q96IV0 654 aa35.71■■■■□ 3.31
SIMC1-211ENST00000514128 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
SIMC1-211ENST00000514128 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
SIMC1-211ENST00000514128 PRAM1Q96QH2 718 aa35.69■■■■□ 3.3
SIMC1-211ENST00000514128 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
SIMC1-211ENST00000514128 ADGRB1O14514 1584 aa35.68■■■■□ 3.3
SIMC1-211ENST00000514128 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.68■■■■□ 3.3
SIMC1-211ENST00000514128 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.68■■■■□ 3.3
SIMC1-211ENST00000514128 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.67■■■■□ 3.3
SIMC1-211ENST00000514128 POGKQ9P215 609 aa35.67■■■■□ 3.3
SIMC1-211ENST00000514128 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
SIMC1-211ENST00000514128 STAC3Q96MF2 364 aa35.64■■■■□ 3.3
SIMC1-211ENST00000514128 ADGRB2O60241 1585 aa35.63■■■■□ 3.29
SIMC1-211ENST00000514128 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
SIMC1-211ENST00000514128 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
SIMC1-211ENST00000514128 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.58■■■■□ 3.29
SIMC1-211ENST00000514128 USP21Q9UK80 565 aa35.57■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.57■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.56■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 RGS12O14924 1447 aa35.55■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.54■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.53■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 USP32Q8NFA0 1604 aa35.53■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.51■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 PSME1Q06323 249 aa35.51■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
SIMC1-211ENST00000514128 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
SIMC1-211ENST00000514128 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
SIMC1-211ENST00000514128 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.47■■■■□ 3.27
SIMC1-211ENST00000514128 ATRNO75882 1429 aa35.46■■■■□ 3.27
SIMC1-211ENST00000514128 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.46■■■■□ 3.27
SIMC1-211ENST00000514128 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
SIMC1-211ENST00000514128 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.44■■■■□ 3.26
SIMC1-211ENST00000514128 SBNO1A3KN83 1393 aa35.43■■■■□ 3.26
SIMC1-211ENST00000514128 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF10O15013 1369 aa35.41■■■■□ 3.26
SIMC1-211ENST00000514128 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.41■■■■□ 3.26
SIMC1-211ENST00000514128 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.41■■■■□ 3.26
SIMC1-211ENST00000514128 ABCA3Q99758 1704 aa35.4■■■■□ 3.26
SIMC1-211ENST00000514128 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.4■■■■□ 3.26
SIMC1-211ENST00000514128 ITSN1Q15811 1721 aa35.4■■■■□ 3.26
SIMC1-211ENST00000514128 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
SIMC1-211ENST00000514128 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.37■■■■□ 3.25
SIMC1-211ENST00000514128 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
SIMC1-211ENST00000514128 PLEKHG5O94827 1062 aa35.35■■■■□ 3.25
SIMC1-211ENST00000514128 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.33■■■■□ 3.25
SIMC1-211ENST00000514128 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.33■■■■□ 3.25
SIMC1-211ENST00000514128 SLIT2O94813 1529 aa35.32■■■■□ 3.25
SIMC1-211ENST00000514128 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.32■■■■□ 3.24
SIMC1-211ENST00000514128 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.31■■■■□ 3.24
SIMC1-211ENST00000514128 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.29■■■■□ 3.24
SIMC1-211ENST00000514128 ALS2Q96Q42 1657 aa35.29■■■■□ 3.24
SIMC1-211ENST00000514128 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.29■■■■□ 3.24
SIMC1-211ENST00000514128 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
SIMC1-211ENST00000514128 ATP7BP35670 1465 aa35.28■■■■□ 3.24
SIMC1-211ENST00000514128 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
SIMC1-211ENST00000514128 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.22■■■■□ 3.23
SIMC1-211ENST00000514128 GLI3P10071 1580 aa35.22■■■■□ 3.23
SIMC1-211ENST00000514128 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.21■■■■□ 3.23
SIMC1-211ENST00000514128 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
SIMC1-211ENST00000514128 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
SIMC1-211ENST00000514128 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.18■■■■□ 3.22
SIMC1-211ENST00000514128 CDK19Q9BWU1 502 aa35.18■■■■□ 3.22
SIMC1-211ENST00000514128 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.15■■■■□ 3.22
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
SIMC1-211ENST00000514128 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
SIMC1-211ENST00000514128 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.14■■■■□ 3.22
SIMC1-211ENST00000514128 VPS72Q15906 364 aa35.13■■■■□ 3.21
SIMC1-211ENST00000514128 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
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