RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508769.1

SIMC1-210, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIMC1, Length 461 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-210ENST00000508769 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
SIMC1-210ENST00000508769 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.45■■■■□ 3.11
SIMC1-210ENST00000508769 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.43■■■■□ 3.1
SIMC1-210ENST00000508769 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SIMC1-210ENST00000508769 MYOM2P54296 1465 aa34.4■■■■□ 3.1
SIMC1-210ENST00000508769 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
SIMC1-210ENST00000508769 ABCC11Q96J66 1382 aa34.39■■■■□ 3.1
SIMC1-210ENST00000508769 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
SIMC1-210ENST00000508769 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
SIMC1-210ENST00000508769 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.35■■■■□ 3.09
SIMC1-210ENST00000508769 NUTM2FA1L443 756 aa34.34■■■■□ 3.09
SIMC1-210ENST00000508769 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
SIMC1-210ENST00000508769 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.34■■■■□ 3.09
SIMC1-210ENST00000508769 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
SIMC1-210ENST00000508769 AFF2P51816 1311 aa34.3■■■■□ 3.08
SIMC1-210ENST00000508769 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.3■■■■□ 3.08
SIMC1-210ENST00000508769 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
SIMC1-210ENST00000508769 PXDNQ92626 1479 aa34.28■■■■□ 3.08
SIMC1-210ENST00000508769 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
SIMC1-210ENST00000508769 C8orf37Q96NL8 207 aa34.25■■■■□ 3.07
SIMC1-210ENST00000508769 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
SIMC1-210ENST00000508769 ADGRB1O14514 1584 aa34.23■■■■□ 3.07
SIMC1-210ENST00000508769 ADAMTS2O95450 1211 aa34.23■■■■□ 3.07
SIMC1-210ENST00000508769 FOXO3O43524 673 aa34.22■■■■□ 3.07
SIMC1-210ENST00000508769 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
SIMC1-210ENST00000508769 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.19■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.18■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 SIRT1Q96EB6 747 aa34.17■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 PRAM1Q96QH2 718 aa34.17■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 KIF1AQ12756 1690 aa34.16■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 HRCP23327 699 aa34.16■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 DLC1Q96QB1 1528 aa34.15■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 RXRBP28702 533 aa34.15■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.14■■■■□ 3.06
SIMC1-210ENST00000508769 USP32Q8NFA0 1604 aa34.12■■■■□ 3.05
SIMC1-210ENST00000508769 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
SIMC1-210ENST00000508769 NGLY1Q96IV0 654 aa34.11■■■■□ 3.05
SIMC1-210ENST00000508769 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
SIMC1-210ENST00000508769 ADGRB2O60241 1585 aa34.08■■■■□ 3.05
SIMC1-210ENST00000508769 RGS12O14924 1447 aa34.08■■■■□ 3.05
SIMC1-210ENST00000508769 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
SIMC1-210ENST00000508769 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.08■■■■□ 3.05
SIMC1-210ENST00000508769 POGKQ9P215 609 aa34.04■■■■□ 3.04
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
SIMC1-210ENST00000508769 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
SIMC1-210ENST00000508769 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.02■■■■□ 3.04
SIMC1-210ENST00000508769 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.02■■■■□ 3.04
SIMC1-210ENST00000508769 USP21Q9UK80 565 aa34.01■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 ABCA3Q99758 1704 aa33.96■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 ATRNO75882 1429 aa33.96■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 ANKARQ7Z5J8 1434 aa33.96■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.95■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 PRR36Q9H6K5 1346 aa33.95■■■■□ 3.03
SIMC1-210ENST00000508769 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.95■■■■□ 3.02
SIMC1-210ENST00000508769 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.94■■■■□ 3.02
SIMC1-210ENST00000508769 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
SIMC1-210ENST00000508769 PLEKHG5O94827 1062 aa33.91■■■■□ 3.02
SIMC1-210ENST00000508769 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.9■■■■□ 3.02
SIMC1-210ENST00000508769 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
SIMC1-210ENST00000508769 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.89■■■■□ 3.02
SIMC1-210ENST00000508769 STAC3Q96MF2 364 aa33.89■■■■□ 3.02
SIMC1-210ENST00000508769 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
SIMC1-210ENST00000508769 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.87■■■■□ 3.01
SIMC1-210ENST00000508769 SBNO1A3KN83 1393 aa33.86■■■■□ 3.01
SIMC1-210ENST00000508769 WASLO00401 505 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
SIMC1-210ENST00000508769 SLIT2O94813 1529 aa33.84■■■■□ 3.01
SIMC1-210ENST00000508769 PSME1Q06323 249 aa33.84■■■■□ 3.01
SIMC1-210ENST00000508769 ALS2Q96Q42 1657 aa33.84■■■■□ 3.01
SIMC1-210ENST00000508769 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.83■■■■□ 3.01
SIMC1-210ENST00000508769 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.82■■■■□ 3
SIMC1-210ENST00000508769 GLI3P10071 1580 aa33.81■■■■□ 3
SIMC1-210ENST00000508769 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
SIMC1-210ENST00000508769 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.8■■■■□ 3
SIMC1-210ENST00000508769 ATP7BP35670 1465 aa33.8■■■■□ 3
SIMC1-210ENST00000508769 ITSN1Q15811 1721 aa33.78■■■■□ 3
SIMC1-210ENST00000508769 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGEF10O15013 1369 aa33.76■■■■□ 3
SIMC1-210ENST00000508769 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.75■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa33.74■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.74■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.74■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.73■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.71■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.71■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 BRWD3Q6RI45 1802 aa33.7■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
SIMC1-210ENST00000508769 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.69■■■□□ 2.98
SIMC1-210ENST00000508769 EP400Q96L91 3159 aa33.68■■■□□ 2.98
SIMC1-210ENST00000508769 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
SIMC1-210ENST00000508769 CDK19Q9BWU1 502 aa33.68■■■□□ 2.98
SIMC1-210ENST00000508769 NRAPQ86VF7 1730 aa33.67■■■□□ 2.98
SIMC1-210ENST00000508769 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.67■■■□□ 2.98
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