RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-205ENST00000502260 RGL3Q3MIN7 710 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 FOXO3O43524 673 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 STK26Q9P289 416 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.68■□□□□ 0.9
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SH3BP2-205ENST00000502260 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 MYOM2P54296 1465 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 ABCC11Q96J66 1382 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 TECPR2O15040 1411 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 ATRNO75882 1429 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 PXDNQ92626 1479 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-205ENST00000502260 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.65■□□□□ 0.9
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SH3BP2-205ENST00000502260 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 PPLO60437 1756 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 PIK3C2GO75747 1445 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 SIRT1Q96EB6 747 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-205ENST00000502260 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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SH3BP2-205ENST00000502260 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 CCDC125Q86Z20 511 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-205ENST00000502260 SLIT2O94813 1529 aa20.52■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 PSME1Q06323 249 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 PRAM1Q96QH2 718 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 IFT172Q9UG01 1749 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-205ENST00000502260 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-205ENST00000502260 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-205ENST00000502260 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-205ENST00000502260 SBNO1A3KN83 1393 aa20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-205ENST00000502260 KIF1AQ12756 1690 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-205ENST00000502260 PLEKHG5O94827 1062 aa20.43■□□□□ 0.86
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SH3BP2-205ENST00000502260 GLI3P10071 1580 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-205ENST00000502260 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-205ENST00000502260 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.42■□□□□ 0.86
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SH3BP2-205ENST00000502260 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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SH3BP2-205ENST00000502260 EP400Q96L91 3159 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-205ENST00000502260 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-205ENST00000502260 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.38■□□□□ 0.85
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SH3BP2-205ENST00000502260 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-205ENST00000502260 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-205ENST00000502260 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-205ENST00000502260 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-205ENST00000502260 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP2-205ENST00000502260 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-205ENST00000502260 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.33■□□□□ 0.85
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SH3BP2-205ENST00000502260 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 BTG4Q9NY30 223 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 ADGRB2O60241 1585 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 STAC3Q96MF2 364 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A0G2JS52 829 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 MYT1Q01538 1121 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-205ENST00000502260 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.24■□□□□ 0.83
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