RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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RABGGTB-214ENST00000497648 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.67□□□□□ -0.54
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RABGGTB-214ENST00000497648 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGGTB-214ENST00000497648 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
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RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-214ENST00000497648 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.64□□□□□ -0.55
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RABGGTB-214ENST00000497648 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.61□□□□□ -0.55
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RABGGTB-214ENST00000497648 ABCC2Q92887 1545 aa11.59□□□□□ -0.55
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RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC125Q86Z20 511 aa11.59□□□□□ -0.55
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RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.58□□□□□ -0.56
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RABGGTB-214ENST00000497648 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-214ENST00000497648 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
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RABGGTB-214ENST00000497648 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-214ENST00000497648 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.57□□□□□ -0.56
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RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF428Q96B54 188 aa11.53□□□□□ -0.56
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RABGGTB-214ENST00000497648 DIP2BQ9P265 1576 aa11.51□□□□□ -0.57
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RABGGTB-214ENST00000497648 KDM4AO75164 1064 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGGTB-214ENST00000497648 TSPOAP1O95153 1857 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGGTB-214ENST00000497648 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
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RABGGTB-214ENST00000497648 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGGTB-214ENST00000497648 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP10BO94823 1461 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.47□□□□□ -0.57
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RABGGTB-214ENST00000497648 NEUROD2Q15784 382 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGGTB-214ENST00000497648 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGGTB-214ENST00000497648 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
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