RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PTPRG-207ENST00000495879 TRPM2O94759 1503 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRG-207ENST00000495879 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 PTPRTO14522 1441 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 KANK1Q14678 1352 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 CEP152O94986 1710 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
PTPRG-207ENST00000495879 MCM4P33991 863 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 NGEFQ8N5V2 710 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 ABCC1P33527 1531 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 WDR63Q8IWG1 891 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 STAC3Q96MF2 364 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 NOS1P29475 1434 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 CFAP53Q96M91 514 aa23.68■■□□□ 1.38
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PTPRG-207ENST00000495879 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 CABP2Q9NPB3 220 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 TRIM27P14373 513 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 ABCA6Q8N139 1617 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRG-207ENST00000495879 TRAK2O60296 914 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 GGT6Q6P531 493 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRG-207ENST00000495879 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 LNPKQ9C0E8 428 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 STK26Q9P289 416 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 CHD1O14646 1710 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 SLC24A1O60721 1099 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRG-207ENST00000495879 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTPRG-207ENST00000495879 HSCBQ8IWL3 235 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.56■■□□□ 1.36
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PTPRG-207ENST00000495879 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.55■■□□□ 1.36
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PTPRG-207ENST00000495879 TET3O43151 1660 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRG-207ENST00000495879 AAMPQ13685 434 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRG-207ENST00000495879 RIPK4P57078 832 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRG-207ENST00000495879 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRG-207ENST00000495879 ATP7AQ04656 1500 aa23.52■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 FANCAO15360 1455 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 MYOM2P54296 1465 aa23.51■■□□□ 1.35
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PTPRG-207ENST00000495879 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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PTPRG-207ENST00000495879 CD109Q6YHK3 1445 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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PTPRG-207ENST00000495879 SMC5Q8IY18 1101 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 EVC2Q86UK5 1308 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 ADGRL1O94910 1474 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRG-207ENST00000495879 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRG-207ENST00000495879 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRG-207ENST00000495879 DEPDC5O75140 1603 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRG-207ENST00000495879 ERBB4Q15303 1308 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRG-207ENST00000495879 MRE11P49959 708 aa23.43■■□□□ 1.34
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