RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.12■■□□□ 1.45
RBM3-211ENST00000491240 C8orf37Q96NL8 207 aa24.12■■□□□ 1.45
RBM3-211ENST00000491240 ADAMTS2O95450 1211 aa24.11■■□□□ 1.45
RBM3-211ENST00000491240 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RBM3-211ENST00000491240 PIK3C2GO75747 1445 aa24.1■■□□□ 1.45
RBM3-211ENST00000491240 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
RBM3-211ENST00000491240 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.08■■□□□ 1.45
RBM3-211ENST00000491240 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 RXRBP28702 533 aa24.06■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 ABCC11Q96J66 1382 aa24.05■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.05■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 TECPR2O15040 1411 aa24.05■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 FOXO3O43524 673 aa24.04■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 NGLY1Q96IV0 654 aa24.03■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 LAMC1P11047 1609 aa24.02■■□□□ 1.44
RBM3-211ENST00000491240 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.01■■□□□ 1.43
RBM3-211ENST00000491240 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.01■■□□□ 1.43
RBM3-211ENST00000491240 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RBM3-211ENST00000491240 NPHP3Q7Z494 1330 aa24■■□□□ 1.43
RBM3-211ENST00000491240 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
RBM3-211ENST00000491240 MYOM2P54296 1465 aa23.98■■□□□ 1.43
RBM3-211ENST00000491240 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.98■■□□□ 1.43
RBM3-211ENST00000491240 PRAM1Q96QH2 718 aa23.97■■□□□ 1.43
RBM3-211ENST00000491240 PXDNQ92626 1479 aa23.96■■□□□ 1.43
RBM3-211ENST00000491240 PLEKHG5O94827 1062 aa23.95■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.95■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.94■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 POGKQ9P215 609 aa23.93■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 USP21Q9UK80 565 aa23.93■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.92■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 SIRT1Q96EB6 747 aa23.91■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 RGS12O14924 1447 aa23.91■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
RBM3-211ENST00000491240 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.89■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.88■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.86■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.85■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 ADGRB1O14514 1584 aa23.85■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 KIF1AQ12756 1690 aa23.84■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.84■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.83■■□□□ 1.41
RBM3-211ENST00000491240 HRCP23327 699 aa23.82■■□□□ 1.4
RBM3-211ENST00000491240 DLC1Q96QB1 1528 aa23.82■■□□□ 1.4
RBM3-211ENST00000491240 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
RBM3-211ENST00000491240 PSME1Q06323 249 aa23.8■■□□□ 1.4
RBM3-211ENST00000491240 ATRNO75882 1429 aa23.79■■□□□ 1.4
RBM3-211ENST00000491240 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.79■■□□□ 1.4
RBM3-211ENST00000491240 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
RBM3-211ENST00000491240 USP32Q8NFA0 1604 aa23.78■■□□□ 1.4
RBM3-211ENST00000491240 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.77■■□□□ 1.4
RBM3-211ENST00000491240 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.76■■□□□ 1.39
RBM3-211ENST00000491240 ADGRB2O60241 1585 aa23.74■■□□□ 1.39
RBM3-211ENST00000491240 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
RBM3-211ENST00000491240 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.73■■□□□ 1.39
RBM3-211ENST00000491240 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.72■■□□□ 1.39
RBM3-211ENST00000491240 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
RBM3-211ENST00000491240 SBNO1A3KN83 1393 aa23.7■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 STAC3Q96MF2 364 aa23.7■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 SLIT2O94813 1529 aa23.69■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.68■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.68■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.67■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 ARHGEF10O15013 1369 aa23.66■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.66■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.66■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 ABCA3Q99758 1704 aa23.64■■□□□ 1.38
RBM3-211ENST00000491240 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 GLI3P10071 1580 aa23.64■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 FAM83GA6ND36 823 aa23.63■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 CDK19Q9BWU1 502 aa23.63■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.61■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.6■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 ATP7BP35670 1465 aa23.6■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.59■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 ALS2Q96Q42 1657 aa23.58■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 VPS72Q15906 364 aa23.58■■□□□ 1.37
RBM3-211ENST00000491240 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.57■■□□□ 1.36
RBM3-211ENST00000491240 BTG4Q9NY30 223 aa23.57■■□□□ 1.36
RBM3-211ENST00000491240 A0A0G2JS52 829 aa23.56■■□□□ 1.36
RBM3-211ENST00000491240 MYT1Q01538 1121 aa23.56■■□□□ 1.36
RBM3-211ENST00000491240 NEUROD1Q13562 356 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms