RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484551.1

C6orf136-210, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 3

Gene C6orf136, Length 613 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-210ENST00000484551 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.27■■□□□ 1.48
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C6orf136-210ENST00000484551 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.25■■□□□ 1.47
C6orf136-210ENST00000484551 ABCC11Q96J66 1382 aa24.23■■□□□ 1.47
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C6orf136-210ENST00000484551 AFF2P51816 1311 aa24.22■■□□□ 1.47
C6orf136-210ENST00000484551 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
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C6orf136-210ENST00000484551 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
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C6orf136-210ENST00000484551 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24■■□□□ 1.43
C6orf136-210ENST00000484551 PHF8Q9UPP1 1060 aa24■■□□□ 1.43
C6orf136-210ENST00000484551 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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C6orf136-210ENST00000484551 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.81■■□□□ 1.4
C6orf136-210ENST00000484551 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.8■■□□□ 1.4
C6orf136-210ENST00000484551 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.79■■□□□ 1.4
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C6orf136-210ENST00000484551 ITSN1Q15811 1721 aa23.78■■□□□ 1.4
C6orf136-210ENST00000484551 GLI3P10071 1580 aa23.78■■□□□ 1.4
C6orf136-210ENST00000484551 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.76■■□□□ 1.39
C6orf136-210ENST00000484551 ATP7BP35670 1465 aa23.76■■□□□ 1.39
C6orf136-210ENST00000484551 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
C6orf136-210ENST00000484551 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.75■■□□□ 1.39
C6orf136-210ENST00000484551 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
C6orf136-210ENST00000484551 CDK19Q9BWU1 502 aa23.74■■□□□ 1.39
C6orf136-210ENST00000484551 FAM83GA6ND36 823 aa23.73■■□□□ 1.39
C6orf136-210ENST00000484551 VPS72Q15906 364 aa23.72■■□□□ 1.39
C6orf136-210ENST00000484551 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
C6orf136-210ENST00000484551 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.7■■□□□ 1.38
C6orf136-210ENST00000484551 EP400Q96L91 3159 aa23.69■■□□□ 1.38
C6orf136-210ENST00000484551 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.69■■□□□ 1.38
C6orf136-210ENST00000484551 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.68■■□□□ 1.38
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