RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.43■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCAR3O75815 825 aa20.42■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRL1O94910 1474 aa20.42■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.42■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.41■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PBRM1Q86U86 1689 aa20.41■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.41■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNAI1P63096 354 aa20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUP160Q12769 1436 aa20.39■□□□□ 0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSME1Q06323 249 aa20.39■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.38■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REC8O95072 547 aa20.38■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRKAR2BP31323 418 aa20.37■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFKBIBQ15653 356 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRAM1Q96QH2 718 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.36■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DISP1Q96F81 1524 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERBINQ96RT1 1412 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NLRP6P59044 892 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FANCAO15360 1455 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLSTN1O94985 981 aa20.35■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.34■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BQV1 296 aa20.33■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFFO2Q5TF58 517 aa20.33■□□□□ 0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.33■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.32■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPKBP1O60336 1514 aa20.32■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLCH2O75038 1416 aa20.32■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCTP1Q6DN14 999 aa20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAMD9Q5K651 1589 aa20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.31■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.3■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHF14O94880 888 aa20.3■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EVA1CP58658 441 aa20.3■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CABP1Q9NZU7 370 aa20.29■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF3AQ9Y496 699 aa20.28■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.27■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF428Q96B54 188 aa20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SKAP1Q86WV1 359 aa20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPM4P67936 248 aa20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASXL2Q76L83 1435 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE3AQ14432 1141 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APPP05067 770 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BACH2Q9BYV9 841 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BECN2A8MW95 431 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABTB2Q8N961 1025 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOSBP53539 338 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK19Q9BWU1 502 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC45O75419 566 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.19■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.19■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AAMPQ13685 434 aa20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BICD2Q8TD16 824 aa20.17■□□□□ 0.82
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