RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 LAMC1P11047 1609 aa33.73■■■□□ 2.99
C9orf3-216ENST00000478603 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa33.72■■■□□ 2.99
C9orf3-216ENST00000478603 PNPLA6Q8IY17 1366 aa33.72■■■□□ 2.99
C9orf3-216ENST00000478603 ABCC11Q96J66 1382 aa33.7■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa33.7■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 MYOM2P54296 1465 aa33.68■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.68■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 CFAP70Q5T0N1 1121 aa33.65■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 ESCO1Q5FWF5 840 aa33.64■■■□□ 2.98
C9orf3-216ENST00000478603 NUTM2FA1L443 756 aa33.63■■■□□ 2.97
C9orf3-216ENST00000478603 AFF2P51816 1311 aa33.61■■■□□ 2.97
C9orf3-216ENST00000478603 C8orf37Q96NL8 207 aa33.58■■■□□ 2.97
C9orf3-216ENST00000478603 FMN2Q9NZ56 1722 aa33.58■■■□□ 2.97
C9orf3-216ENST00000478603 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
C9orf3-216ENST00000478603 NPHP3Q7Z494 1330 aa33.54■■■□□ 2.96
C9orf3-216ENST00000478603 ADAMTS2O95450 1211 aa33.54■■■□□ 2.96
C9orf3-216ENST00000478603 HRCP23327 699 aa33.54■■■□□ 2.96
C9orf3-216ENST00000478603 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
C9orf3-216ENST00000478603 SIRT1Q96EB6 747 aa33.54■■■□□ 2.96
C9orf3-216ENST00000478603 PXDNQ92626 1479 aa33.53■■■□□ 2.96
C9orf3-216ENST00000478603 FOXO3O43524 673 aa33.53■■■□□ 2.96
C9orf3-216ENST00000478603 RXRBP28702 533 aa33.51■■■□□ 2.95
C9orf3-216ENST00000478603 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.51■■■□□ 2.95
C9orf3-216ENST00000478603 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
C9orf3-216ENST00000478603 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP33.5■■■□□ 2.95
C9orf3-216ENST00000478603 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
C9orf3-216ENST00000478603 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.49■■■□□ 2.95
C9orf3-216ENST00000478603 PRAM1Q96QH2 718 aa33.48■■■□□ 2.95
C9orf3-216ENST00000478603 NGLY1Q96IV0 654 aa33.47■■■□□ 2.95
C9orf3-216ENST00000478603 ADGRB1O14514 1584 aa33.47■■■□□ 2.95
C9orf3-216ENST00000478603 KIF1AQ12756 1690 aa33.45■■■□□ 2.94
C9orf3-216ENST00000478603 DLC1Q96QB1 1528 aa33.43■■■□□ 2.94
C9orf3-216ENST00000478603 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
C9orf3-216ENST00000478603 POGKQ9P215 609 aa33.41■■■□□ 2.94
C9orf3-216ENST00000478603 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.4■■■□□ 2.94
C9orf3-216ENST00000478603 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
C9orf3-216ENST00000478603 PHF8Q9UPP1 1060 aa33.36■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 KRT28Q7Z3Y7 464 aa33.35■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 USP21Q9UK80 565 aa33.35■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.33■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 USP32Q8NFA0 1604 aa33.33■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 RGS12O14924 1447 aa33.33■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 ADGRB2O60241 1585 aa33.33■■■□□ 2.93
C9orf3-216ENST00000478603 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
C9orf3-216ENST00000478603 STAC3Q96MF2 364 aa33.32■■■□□ 2.92
C9orf3-216ENST00000478603 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.31■■■□□ 2.92
C9orf3-216ENST00000478603 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
C9orf3-216ENST00000478603 ANKARQ7Z5J8 1434 aa33.27■■■□□ 2.92
C9orf3-216ENST00000478603 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.26■■■□□ 2.91
C9orf3-216ENST00000478603 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
C9orf3-216ENST00000478603 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
C9orf3-216ENST00000478603 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.25■■■□□ 2.91
C9orf3-216ENST00000478603 PSME1Q06323 249 aa33.24■■■□□ 2.91
C9orf3-216ENST00000478603 ATRNO75882 1429 aa33.24■■■□□ 2.91
C9orf3-216ENST00000478603 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.23■■■□□ 2.91
C9orf3-216ENST00000478603 PLEKHG5O94827 1062 aa33.21■■■□□ 2.91
C9orf3-216ENST00000478603 PRR36Q9H6K5 1346 aa33.21■■■□□ 2.91
C9orf3-216ENST00000478603 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.19■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 WASLO00401 505 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 SBNO1A3KN83 1393 aa33.19■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.18■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.18■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.16■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 ABCA3Q99758 1704 aa33.15■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
C9orf3-216ENST00000478603 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.89
C9orf3-216ENST00000478603 SLIT2O94813 1529 aa33.12■■■□□ 2.89
C9orf3-216ENST00000478603 ARHGEF10O15013 1369 aa33.12■■■□□ 2.89
C9orf3-216ENST00000478603 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.1■■■□□ 2.89
C9orf3-216ENST00000478603 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.09■■■□□ 2.89
C9orf3-216ENST00000478603 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
C9orf3-216ENST00000478603 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.08■■■□□ 2.89
C9orf3-216ENST00000478603 ALS2Q96Q42 1657 aa33.07■■■□□ 2.89
C9orf3-216ENST00000478603 ITSN1Q15811 1721 aa33.07■■■□□ 2.88
C9orf3-216ENST00000478603 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.07■■■□□ 2.88
C9orf3-216ENST00000478603 ATP7BP35670 1465 aa33.06■■■□□ 2.88
C9orf3-216ENST00000478603 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
C9orf3-216ENST00000478603 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
C9orf3-216ENST00000478603 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.04■■■□□ 2.88
C9orf3-216ENST00000478603 GLI3P10071 1580 aa33.04■■■□□ 2.88
C9orf3-216ENST00000478603 CDK19Q9BWU1 502 aa33.03■■■□□ 2.88
C9orf3-216ENST00000478603 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.03■■■□□ 2.88
C9orf3-216ENST00000478603 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.01■■■□□ 2.87
C9orf3-216ENST00000478603 SIN3AQ96ST3 1273 aa33■■■□□ 2.87
C9orf3-216ENST00000478603 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.99■■■□□ 2.87
C9orf3-216ENST00000478603 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
C9orf3-216ENST00000478603 FAM83GA6ND36 823 aa32.97■■■□□ 2.87
C9orf3-216ENST00000478603 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.97■■■□□ 2.87
C9orf3-216ENST00000478603 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa32.95■■■□□ 2.87
C9orf3-216ENST00000478603 NEUROD1Q13562 356 aa32.93■■■□□ 2.86
C9orf3-216ENST00000478603 VPS72Q15906 364 aa32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.1 ms