RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, human

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA1-209	ENST00000469140	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MTA1-209	ENST00000469140	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MTA1-209	ENST00000469140	HSPA2	P54652	639 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MTA1-209	ENST00000469140	MIER1	Q8N108	512 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MTA1-209	ENST00000469140	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
MTA1-209	ENST00000469140	ANP32C	O43423	234 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MTA1-209	ENST00000469140	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
MTA1-209	ENST00000469140	KCNA6	P17658	529 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MTA1-209	ENST00000469140	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MTA1-209	ENST00000469140	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA1-209	ENST00000469140	PANK3	Q9H999	370 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MTA1-209	ENST00000469140	CABP2	Q9NPB3	220 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA1-209	ENST00000469140	MYOM1	P52179	1685 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MTA1-209	ENST00000469140	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MTA1-209	ENST00000469140	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
MTA1-209	ENST00000469140	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MTA1-209	ENST00000469140	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA1-209	ENST00000469140	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MTA1-209	ENST00000469140	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
MTA1-209	ENST00000469140	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MTA1-209	ENST00000469140	TMC1	Q8TDI8	760 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MTA1-209	ENST00000469140	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MTA1-209	ENST00000469140	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MTA1-209	ENST00000469140	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
MTA1-209	ENST00000469140	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.27	■■■□□ 2.76
MTA1-209	ENST00000469140	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
MTA1-209	ENST00000469140	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MTA1-209	ENST00000469140	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
MTA1-209	ENST00000469140	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
MTA1-209	ENST00000469140	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MTA1-209	ENST00000469140	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MTA1-209	ENST00000469140	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MTA1-209	ENST00000469140	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MTA1-209	ENST00000469140	CABP1	Q9NZU7	370 aa		32.2	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	ATP7B	P35670	1465 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	RALBP1	Q15311	655 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.17	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140		A0A1W2PP64	1363 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MTA1-209	ENST00000469140	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.14	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.12	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.12	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.11	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.07	■■■□□ 2.73
MTA1-209	ENST00000469140	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
MTA1-209	ENST00000469140	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
MTA1-209	ENST00000469140	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MTA1-209	ENST00000469140	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MTA1-209	ENST00000469140	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
MTA1-209	ENST00000469140	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MTA1-209	ENST00000469140	NSD2	O96028	1365 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
MTA1-209	ENST00000469140	ACE	P12821	1306 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MTA1-209	ENST00000469140	DCC	P43146	1447 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MTA1-209	ENST00000469140	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
MTA1-209	ENST00000469140	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MTA1-209	ENST00000469140	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
MTA1-209	ENST00000469140	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31.95	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	MRS2	Q9HD23	443 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		31.93	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	ATF3	P18847	181 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	FYB1	O15117	783 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	MSH6	P52701	1360 aa		31.91	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	USP6	P35125	1406 aa		31.89	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.89	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.89	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	PPP2R1A	P30153	589 aa		31.89	■■■□□ 2.7
MTA1-209	ENST00000469140	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.88	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.86	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.86	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MTA1-209	ENST00000469140	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		31.84	■■■□□ 2.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90 ms