RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469137.5

LIN7B-204, Transcript of lin-7 homolog B, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene LIN7B, Length 1,057 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7B-204ENST00000469137 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
LIN7B-204ENST00000469137 RXRBP28702 533 aa42.03■■■■■ 4.32
LIN7B-204ENST00000469137 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
LIN7B-204ENST00000469137 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
LIN7B-204ENST00000469137 C8orf37Q96NL8 207 aa41.98■■■■■ 4.31
LIN7B-204ENST00000469137 STK26Q9P289 416 aa41.98■■■■■ 4.31
LIN7B-204ENST00000469137 ABCC11Q96J66 1382 aa41.98■■■■■ 4.31
LIN7B-204ENST00000469137 ESCO1Q5FWF5 840 aa41.93■■■■■ 4.3
LIN7B-204ENST00000469137 NPHP3Q7Z494 1330 aa41.93■■■■■ 4.3
LIN7B-204ENST00000469137 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.92■■■■■ 4.3
LIN7B-204ENST00000469137 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.91■■■■■ 4.3
LIN7B-204ENST00000469137 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
LIN7B-204ENST00000469137 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
LIN7B-204ENST00000469137 ADAMTS2O95450 1211 aa41.89■■■■■ 4.3
LIN7B-204ENST00000469137 MYOM2P54296 1465 aa41.88■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.88■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.87■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 NGLY1Q96IV0 654 aa41.87■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 FMN2Q9NZ56 1722 aa41.85■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.85■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 PXDNQ92626 1479 aa41.85■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
LIN7B-204ENST00000469137 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.8■■■■■ 4.28
LIN7B-204ENST00000469137 SIRT1Q96EB6 747 aa41.8■■■■■ 4.28
LIN7B-204ENST00000469137 FOXO3O43524 673 aa41.79■■■■■ 4.28
LIN7B-204ENST00000469137 KIF1AQ12756 1690 aa41.78■■■■■ 4.28
LIN7B-204ENST00000469137 NUTM2FA1L443 756 aa41.78■■■■■ 4.28
LIN7B-204ENST00000469137 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
LIN7B-204ENST00000469137 RGS12O14924 1447 aa41.75■■■■■ 4.27
LIN7B-204ENST00000469137 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.73■■■■■ 4.27
LIN7B-204ENST00000469137 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
LIN7B-204ENST00000469137 USP21Q9UK80 565 aa41.72■■■■■ 4.27
LIN7B-204ENST00000469137 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
LIN7B-204ENST00000469137 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
LIN7B-204ENST00000469137 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
LIN7B-204ENST00000469137 DLC1Q96QB1 1528 aa41.65■■■■■ 4.26
LIN7B-204ENST00000469137 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
LIN7B-204ENST00000469137 PRAM1Q96QH2 718 aa41.61■■■■■ 4.25
LIN7B-204ENST00000469137 ATRNO75882 1429 aa41.6■■■■■ 4.25
LIN7B-204ENST00000469137 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa41.59■■■■■ 4.25
LIN7B-204ENST00000469137 ADGRB1O14514 1584 aa41.58■■■■■ 4.25
LIN7B-204ENST00000469137 HRCP23327 699 aa41.56■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 POGKQ9P215 609 aa41.56■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 PHF8Q9UPP1 1060 aa41.56■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.55■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 ADGRB2O60241 1585 aa41.54■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.53■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 PSME1Q06323 249 aa41.51■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 STAC3Q96MF2 364 aa41.51■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.51■■■■■ 4.24
LIN7B-204ENST00000469137 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.5■■■■■ 4.23
LIN7B-204ENST00000469137 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.5■■■■■ 4.23
LIN7B-204ENST00000469137 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.49■■■■■ 4.23
LIN7B-204ENST00000469137 USP32Q8NFA0 1604 aa41.48■■■■■ 4.23
LIN7B-204ENST00000469137 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.47■■■■■ 4.23
LIN7B-204ENST00000469137 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.44■■■■■ 4.22
LIN7B-204ENST00000469137 SBNO1A3KN83 1393 aa41.44■■■■■ 4.22
LIN7B-204ENST00000469137 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
LIN7B-204ENST00000469137 SLIT2O94813 1529 aa41.41■■■■■ 4.22
LIN7B-204ENST00000469137 ARHGEF10O15013 1369 aa41.4■■■■■ 4.22
LIN7B-204ENST00000469137 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
LIN7B-204ENST00000469137 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
LIN7B-204ENST00000469137 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.37■■■■■ 4.21
LIN7B-204ENST00000469137 ABCA3Q99758 1704 aa41.37■■■■■ 4.21
LIN7B-204ENST00000469137 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
LIN7B-204ENST00000469137 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
LIN7B-204ENST00000469137 TULP4Q9NRJ4 1543 aa41.34■■■■■ 4.21
LIN7B-204ENST00000469137 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa41.34■■■■■ 4.21
LIN7B-204ENST00000469137 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.33■■■■■ 4.21
LIN7B-204ENST00000469137 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.31■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.3■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.3■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 EP400Q96L91 3159 aa41.3■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.29■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 GLI3P10071 1580 aa41.29■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.27■■■■■ 4.2
LIN7B-204ENST00000469137 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.24■■■■■ 4.19
LIN7B-204ENST00000469137 PLEKHG5O94827 1062 aa41.24■■■■■ 4.19
LIN7B-204ENST00000469137 ITSN1Q15811 1721 aa41.24■■■■■ 4.19
LIN7B-204ENST00000469137 ALS2Q96Q42 1657 aa41.23■■■■■ 4.19
LIN7B-204ENST00000469137 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.21■■■■■ 4.19
LIN7B-204ENST00000469137 CCDC125Q86Z20 511 aa41.19■■■■■ 4.18
LIN7B-204ENST00000469137 VPS72Q15906 364 aa41.18■■■■■ 4.18
LIN7B-204ENST00000469137 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
LIN7B-204ENST00000469137 ATP7BP35670 1465 aa41.14■■■■■ 4.18
LIN7B-204ENST00000469137 BRWD3Q6RI45 1802 aa41.14■■■■■ 4.18
LIN7B-204ENST00000469137 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
LIN7B-204ENST00000469137 FAM83GA6ND36 823 aa41.1■■■■■ 4.17
LIN7B-204ENST00000469137 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
LIN7B-204ENST00000469137 NRAPQ86VF7 1730 aa41.09■■■■■ 4.17
LIN7B-204ENST00000469137 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.08■■■■■ 4.17
LIN7B-204ENST00000469137 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
LIN7B-204ENST00000469137 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.06■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms