RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461691.6

ZBED1-204, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-204ENST00000461691 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.66■□□□□ 0.9
ZBED1-204ENST00000461691 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.65■□□□□ 0.9
ZBED1-204ENST00000461691 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 ABCC11Q96J66 1382 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 MYOM2P54296 1465 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.6■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.59■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.59■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 AFF2P51816 1311 aa20.58■□□□□ 0.89
ZBED1-204ENST00000461691 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.57■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 HRCP23327 699 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 SIRT1Q96EB6 747 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 C8orf37Q96NL8 207 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 NUTM2FA1L443 756 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 RXRBP28702 533 aa20.54■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 ADAMTS2O95450 1211 aa20.53■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 PXDNQ92626 1479 aa20.52■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 FOXO3O43524 673 aa20.52■□□□□ 0.88
ZBED1-204ENST00000461691 NGLY1Q96IV0 654 aa20.51■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 KIF1AQ12756 1690 aa20.51■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.49■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 DLC1Q96QB1 1528 aa20.48■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.48■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 PRAM1Q96QH2 718 aa20.48■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 STAC3Q96MF2 364 aa20.47■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 POGKQ9P215 609 aa20.47■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 ADGRB1O14514 1584 aa20.46■□□□□ 0.87
ZBED1-204ENST00000461691 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 USP21Q9UK80 565 aa20.43■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.43■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.42■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.42■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 ADGRB2O60241 1585 aa20.42■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.41■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 RGS12O14924 1447 aa20.4■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
ZBED1-204ENST00000461691 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.39■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 PSME1Q06323 249 aa20.39■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 USP32Q8NFA0 1604 aa20.38■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 ATRNO75882 1429 aa20.36■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.36■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.34■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 SBNO1A3KN83 1393 aa20.34■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.33■□□□□ 0.85
ZBED1-204ENST00000461691 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.32■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.32■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.31■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 ARHGEF10O15013 1369 aa20.31■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 ABCA3Q99758 1704 aa20.3■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.29■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 SLIT2O94813 1529 aa20.28■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 PLEKHG5O94827 1062 aa20.28■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.28■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.28■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 ITSN1Q15811 1721 aa20.27■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.27■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ZBED1-204ENST00000461691 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.26■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 ALS2Q96Q42 1657 aa20.25■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.24■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.24■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 ATP7BP35670 1465 aa20.23■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.22■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 GLI3P10071 1580 aa20.21■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.21■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 CDK19Q9BWU1 502 aa20.21■□□□□ 0.83
ZBED1-204ENST00000461691 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ZBED1-204ENST00000461691 VPS72Q15906 364 aa20.18■□□□□ 0.82
ZBED1-204ENST00000461691 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED1-204ENST00000461691 FAM83GA6ND36 823 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ZBED1-204ENST00000461691 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED1-204ENST00000461691 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED1-204ENST00000461691 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms