RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453632.5

TTC28-AS1-218, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-218ENST00000453632 GLI3P10071 1580 aa18.38■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.38■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.34■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.34■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PXDNQ92626 1479 aa18.32■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NUP155O75694 1391 aa18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CLTCL1P53675 1640 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.28■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.28■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SLIT2O94813 1529 aa18.28■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HRCP23327 699 aa18.27■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIF1BO60333 1816 aa18.27■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FOXO3O43524 673 aa18.26■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.26■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-218ENST00000453632 USP32Q8NFA0 1604 aa18.24■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.24■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PLCH1Q4KWH8 1693 aa18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ROCK1Q13464 1354 aa18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NUTM2FA1L443 756 aa18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HFM1A2PYH4 1435 aa18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BAG6P46379 1132 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PLEKHG5O94827 1062 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 VPS72Q15906 364 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCA3Q99758 1704 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NAIPQ13075 1403 aa18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 A0A0G2JS52 829 aa18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MYT1Q01538 1121 aa18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PPLO60437 1756 aa18.14■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-218ENST00000453632 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ITGAEP38570 1179 aa18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIF1AQ12756 1690 aa18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FMN2Q9NZ56 1722 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 YY1P25490 414 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NRAPQ86VF7 1730 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FAM182BQ5T319 152 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.08■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-218ENST00000453632 STK26Q9P289 416 aa18.08■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 IFT172Q9UG01 1749 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FAM83GA6ND36 823 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DISP2A7MBM2 1401 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TECPR2O15040 1411 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ADGRB2O60241 1585 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PSME1Q06323 249 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BTG4Q9NY30 223 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PHF8Q9UPP1 1060 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARHGEF10O15013 1369 aa17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RREB1Q92766 1687 aa17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NUP188Q5SRE5 1749 aa17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SBNO1A3KN83 1393 aa17.97■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CAMKK2Q96RR4 588 aa17.97■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NRXN1Q9ULB1 1477 aa17.96■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa17.96■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCC11Q96J66 1382 aa17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TRIM37O94972 964 aa17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 APBA3O96018 575 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ALS2Q96Q42 1657 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.91■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RGL3Q3MIN7 710 aa17.89■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FAM196AQ6ZSG2 479 aa17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms