RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM132EQ6IEE7 984 aa38.74■■■■□ 3.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa38.74■■■■□ 3.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCC11Q96J66 1382 aa38.71■■■■□ 3.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WAPLQ7Z5K2 1190 aa38.7■■■■□ 3.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KNDC1Q76NI1 1749 aa38.69■■■■□ 3.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFF2P51816 1311 aa38.66■■■■□ 3.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESCO1Q5FWF5 840 aa38.65■■■■□ 3.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYOM2P54296 1465 aa38.63■■■■□ 3.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRXN1Q9ULB1 1477 aa38.63■■■■□ 3.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa38.62■■■■□ 3.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8orf37Q96NL8 207 aa38.62■■■■□ 3.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RXRBP28702 533 aa38.61■■■■□ 3.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPHP3Q7Z494 1330 aa38.59■■■■□ 3.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP70Q5T0N1 1121 aa38.58■■■■□ 3.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUTM2FA1L443 756 aa38.57■■■■□ 3.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS2O95450 1211 aa38.56■■■■□ 3.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIRT1Q96EB6 747 aa38.56■■■■□ 3.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXO3O43524 673 aa38.52■■■■□ 3.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NGLY1Q96IV0 654 aa38.52■■■■□ 3.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMN2Q9NZ56 1722 aa38.52■■■■□ 3.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PXDNQ92626 1479 aa38.51■■■■□ 3.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HRCP23327 699 aa38.49■■■■□ 3.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAM1Q96QH2 718 aa38.42■■■■□ 3.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF1AQ12756 1690 aa38.42■■■■□ 3.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP38.4■■■■□ 3.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLC1Q96QB1 1528 aa38.39■■■■□ 3.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa38.39■■■■□ 3.74
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF11Q8TEB1 546 aa38.38■■■■□ 3.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POGKQ9P215 609 aa38.38■■■■□ 3.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP21Q9UK80 565 aa38.38■■■■□ 3.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP38.37■■■■□ 3.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRB1O14514 1584 aa38.36■■■■□ 3.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS12O14924 1447 aa38.33■■■■□ 3.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAC3Q96MF2 364 aa38.33■■■■□ 3.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT28Q7Z3Y7 464 aa38.32■■■■□ 3.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF8Q9UPP1 1060 aa38.32■■■■□ 3.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa38.31■■■■□ 3.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAK1Q9UPV9 953 aa38.3■■■■□ 3.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRB2O60241 1585 aa38.25■■■■□ 3.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKARQ7Z5J8 1434 aa38.24■■■■□ 3.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSME1Q06323 249 aa38.24■■■■□ 3.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATRNO75882 1429 aa38.23■■■■□ 3.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNS3Q68CZ2 1445 aa38.21■■■■□ 3.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP32Q8NFA0 1604 aa38.2■■■■□ 3.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL9LQ86UU0 1499 aa38.19■■■■□ 3.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SBNO1A3KN83 1393 aa38.17■■■■□ 3.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa38.16■■■■□ 3.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WASLO00401 505 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMOD2Q6P5Q4 547 aa38.11■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF10O15013 1369 aa38.1■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TULP4Q9NRJ4 1543 aa38.1■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABLES1Q8TDN4 633 aa38.08■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR36Q9H6K5 1346 aa38.08■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLIT2O94813 1529 aa38.07■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATAD2Q6PL18 1390 aa38.07■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHG5O94827 1062 aa38.07■■■■□ 3.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC5CLQ8IV45 518 aa38.07■■■■□ 3.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPRASP1Q5JY77 1395 aa38.04■■■■□ 3.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCA3Q99758 1704 aa38.01■■■■□ 3.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa38■■■■□ 3.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.96■■■■□ 3.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLI3P10071 1580 aa37.95■■■■□ 3.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCH1Q4KWH8 1693 aa37.94■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALS2Q96Q42 1657 aa37.94■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITSN1Q15811 1721 aa37.92■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NWD2Q9ULI1 1742 aa37.92■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP7BP35670 1465 aa37.92■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS72Q15906 364 aa37.9■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF1Q3BBV0 1214 aa37.9■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK19Q9BWU1 502 aa37.89■■■■□ 3.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM83GA6ND36 823 aa37.88■■■■□ 3.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP37.88■■■■□ 3.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EP400Q96L91 3159 aa37.84■■■■□ 3.65
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC125Q86Z20 511 aa37.79■■■■□ 3.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC61Q9Y6R9 512 aa37.79■■■■□ 3.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
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